そろそろ来るかな？ S:T1117I
T1117I←もうこれほとんど棒が６本立ってるのと変わらんな……
||||||
XFY
C24912T, T4714C, C6543T
NB.1.8.1
C22995C, C24912T, G25352T, C24990T
XFG.5.1.4
C22995C, C2485T, C6543T, C24990T
XFG.22
C24912T, C449T, G24434T
T1117I←もうこれほとんど棒が６本立ってるのと変わらんな……
||||||
XFY
C24912T, T4714C, C6543T
NB.1.8.1
C22995C, C24912T, G25352T, C24990T
XFG.5.1.4
C22995C, C2485T, C6543T, C24990T
XFG.22
C24912T, C449T, G24434T
November 1, 2025 at 12:29 AM
そろそろ来るかな？ S:T1117I
T1117I←もうこれほとんど棒が６本立ってるのと変わらんな……
||||||
XFY
C24912T, T4714C, C6543T
NB.1.8.1
C22995C, C24912T, G25352T, C24990T
XFG.5.1.4
C22995C, C2485T, C6543T, C24990T
XFG.22
C24912T, C449T, G24434T
T1117I←もうこれほとんど棒が６本立ってるのと変わらんな……
||||||
XFY
C24912T, T4714C, C6543T
NB.1.8.1
C22995C, C24912T, G25352T, C24990T
XFG.5.1.4
C22995C, C2485T, C6543T, C24990T
XFG.22
C24912T, C449T, G24434T
October 12, 2025 at 11:50 AM
NB.1.8.1 + ORF1a:P1640S(BA.2.75)
S:I478T(rev, S:T1117I, S:V1264L
2 seq (Korea, Japan)
シーケンスが少ないからこれだけ変異しても隠れられていたと
日本がんばって～
nextstrain.org/fetch/genome...
cov-spectrum.org/explore/Asia...
S:I478T(rev, S:T1117I, S:V1264L
2 seq (Korea, Japan)
シーケンスが少ないからこれだけ変異しても隠れられていたと
日本がんばって～
nextstrain.org/fetch/genome...
cov-spectrum.org/explore/Asia...
October 3, 2025 at 10:31 AM
NB.1.8.1 + ORF1a:P1640S(BA.2.75)
S:I478T(rev, S:T1117I, S:V1264L
2 seq (Korea, Japan)
シーケンスが少ないからこれだけ変異しても隠れられていたと
日本がんばって～
nextstrain.org/fetch/genome...
cov-spectrum.org/explore/Asia...
S:I478T(rev, S:T1117I, S:V1264L
2 seq (Korea, Japan)
シーケンスが少ないからこれだけ変異しても隠れられていたと
日本がんばって～
nextstrain.org/fetch/genome...
cov-spectrum.org/explore/Asia...
September 15, 2025 at 12:21 AM
XFG.5.1.1(S:A688V) + S:V642G, S:L822F(1 seq)
S:A688*変異にS:V642Gって相性いい？
BA.3.2(S:A688D)
BQ.1.1.1(S:A688T)
S:A688*変異にS:V642Gって相性いい？
BA.3.2(S:A688D)
BQ.1.1.1(S:A688T)
September 15, 2025 at 12:05 AM
XFG.5.1.1(S:A688V) + S:V642G, S:L822F(1 seq)
S:A688*変異にS:V642Gって相性いい？
BA.3.2(S:A688D)
BQ.1.1.1(S:A688T)
S:A688*変異にS:V642Gって相性いい？
BA.3.2(S:A688D)
BQ.1.1.1(S:A688T)
XFG系統で発生回数はそれなりにあるのになかなか広がらないS:V642G
XFG.4 + S:V642G 3seq(Romania 2, England 1)
cov-spectrum.org/explore/Worl...
Romaniaで感染者数が低い水準でも増加傾向なのとシーケンスの少なさ
2seqながらも日付と親から獲得している変異の違いを考えると広がっている可能性も
www.digi24.ro/stiri/actual...
XFG.4 + S:V642G 3seq(Romania 2, England 1)
cov-spectrum.org/explore/Worl...
Romaniaで感染者数が低い水準でも増加傾向なのとシーケンスの少なさ
2seqながらも日付と親から獲得している変異の違いを考えると広がっている可能性も
www.digi24.ro/stiri/actual...
September 4, 2025 at 8:29 AM
XFG系統で発生回数はそれなりにあるのになかなか広がらないS:V642G
XFG.4 + S:V642G 3seq(Romania 2, England 1)
cov-spectrum.org/explore/Worl...
Romaniaで感染者数が低い水準でも増加傾向なのとシーケンスの少なさ
2seqながらも日付と親から獲得している変異の違いを考えると広がっている可能性も
www.digi24.ro/stiri/actual...
XFG.4 + S:V642G 3seq(Romania 2, England 1)
cov-spectrum.org/explore/Worl...
Romaniaで感染者数が低い水準でも増加傾向なのとシーケンスの少なさ
2seqながらも日付と親から獲得している変異の違いを考えると広がっている可能性も
www.digi24.ro/stiri/actual...
XEC.27.2 + S:K478T(rev (6 seq, 3 countries)
T6763C, C22995C, C26028T
cov-spectrum.org/explore/Worl...
nextstrain.org/fetch/genome...
メキシコの1seqがミステリー
ORF7a:I100Vの枝からORF1ab:T1429K, ORF1ab:L1434Fを持っていて
ORF7a:I100Vを欠いていて
S:K182Nの別の枝のT6763C, S:K478Tを持っている
T6763C, C22995C, C26028T
cov-spectrum.org/explore/Worl...
nextstrain.org/fetch/genome...
メキシコの1seqがミステリー
ORF7a:I100Vの枝からORF1ab:T1429K, ORF1ab:L1434Fを持っていて
ORF7a:I100Vを欠いていて
S:K182Nの別の枝のT6763C, S:K478Tを持っている
August 25, 2025 at 5:38 AM
XEC.27.2 + S:K478T(rev (6 seq, 3 countries)
T6763C, C22995C, C26028T
cov-spectrum.org/explore/Worl...
nextstrain.org/fetch/genome...
メキシコの1seqがミステリー
ORF7a:I100Vの枝からORF1ab:T1429K, ORF1ab:L1434Fを持っていて
ORF7a:I100Vを欠いていて
S:K182Nの別の枝のT6763C, S:K478Tを持っている
T6763C, C22995C, C26028T
cov-spectrum.org/explore/Worl...
nextstrain.org/fetch/genome...
メキシコの1seqがミステリー
ORF7a:I100Vの枝からORF1ab:T1429K, ORF1ab:L1434Fを持っていて
ORF7a:I100Vを欠いていて
S:K182Nの別の枝のT6763C, S:K478Tを持っている
August 25, 2025 at 5:30 AM
covspectrumで見たい変異が検索でヒットしないなーと思ったら全体の数がこんなことに…
データ更新中かな？
データ更新中かな？
August 17, 2025 at 2:30 AM
covspectrumで見たい変異が検索でヒットしないなーと思ったら全体の数がこんなことに…
データ更新中かな？
データ更新中かな？
August 3, 2025 at 2:59 AM
LP.8.1.5 + S:V642G, S:V1122L(4 seq, NY)
C6449T, T23487G, G24926T
cov-spectrum.org/explore/Worl...
高齢者施設のミニクラスター？
消えそうだけど一応記念カキコ
nextstrain.org/fetch/genome...
C6449T, T23487G, G24926T
cov-spectrum.org/explore/Worl...
高齢者施設のミニクラスター？
消えそうだけど一応記念カキコ
nextstrain.org/fetch/genome...
June 23, 2025 at 5:10 AM
LP.8.1.5 + S:V642G, S:V1122L(4 seq, NY)
C6449T, T23487G, G24926T
cov-spectrum.org/explore/Worl...
高齢者施設のミニクラスター？
消えそうだけど一応記念カキコ
nextstrain.org/fetch/genome...
C6449T, T23487G, G24926T
cov-spectrum.org/explore/Worl...
高齢者施設のミニクラスター？
消えそうだけど一応記念カキコ
nextstrain.org/fetch/genome...
NB.1.8.1 + S:G181A(7seq, NZ)
T15741C, G22104C
cov-spectrum.org/explore/Worl...
久しぶりにS:G181A見たなぁ
nextstrain.org/fetch/genome...
T15741C, G22104C
cov-spectrum.org/explore/Worl...
久しぶりにS:G181A見たなぁ
nextstrain.org/fetch/genome...
June 19, 2025 at 8:47 PM
NB.1.8.1 + S:G181A(7seq, NZ)
T15741C, G22104C
cov-spectrum.org/explore/Worl...
久しぶりにS:G181A見たなぁ
nextstrain.org/fetch/genome...
T15741C, G22104C
cov-spectrum.org/explore/Worl...
久しぶりにS:G181A見たなぁ
nextstrain.org/fetch/genome...
June 8, 2025 at 1:58 AM
May 29, 2025 at 12:43 AM
XEV～XFM追加
docs.google.com/spreadsheets...
docs.google.com/spreadsheets...
May 15, 2025 at 3:17 PM
XEV～XFM追加
docs.google.com/spreadsheets...
docs.google.com/spreadsheets...
May 3, 2025 at 4:21 AM
みんな大好きcovspectrumで見る収斂変異の獲得競争
XDV - NB.1.8.1
JN.1
- LF.7.7.2
- LB.1.3.1(NL)
- LP.8.1.1(NY)
- XEC.25.1
XDV - NB.1.8.1
JN.1
- LF.7.7.2
- LB.1.3.1(NL)
- LP.8.1.1(NY)
- XEC.25.1
May 3, 2025 at 4:21 AM
みんな大好きcovspectrumで見る収斂変異の獲得競争
XDV - NB.1.8.1
JN.1
- LF.7.7.2
- LB.1.3.1(NL)
- LP.8.1.1(NY)
- XEC.25.1
XDV - NB.1.8.1
JN.1
- LF.7.7.2
- LB.1.3.1(NL)
- LP.8.1.1(NY)
- XEC.25.1
ブラジルのこの余分なものがついてる39 seq
nt Unique (13) S:I1232F, S:K1245N, S:G1246F, S:C1250S...
XEC + 435S, 679Rでも日付の古いシーケンスで1件引っかかる
除外したほうがいいのか悩む
cov-spectrum.org/explore/Worl...
nt Unique (13) S:I1232F, S:K1245N, S:G1246F, S:C1250S...
XEC + 435S, 679Rでも日付の古いシーケンスで1件引っかかる
除外したほうがいいのか悩む
cov-spectrum.org/explore/Worl...
April 21, 2025 at 9:28 AM
ブラジルのこの余分なものがついてる39 seq
nt Unique (13) S:I1232F, S:K1245N, S:G1246F, S:C1250S...
XEC + 435S, 679Rでも日付の古いシーケンスで1件引っかかる
除外したほうがいいのか悩む
cov-spectrum.org/explore/Worl...
nt Unique (13) S:I1232F, S:K1245N, S:G1246F, S:C1250S...
XEC + 435S, 679Rでも日付の古いシーケンスで1件引っかかる
除外したほうがいいのか悩む
cov-spectrum.org/explore/Worl...
HP.1.1 Alias of XBB.1.5.55.1.1
+ S:C15Y,S:W64L,S:G72V,S:T95I,S:I101T,S:H146K,S:W152C,S:S172F,S:L176-,S:M177-,S:D178-,S:D215H,S:L242-,S:A243-,S:G446N,S:F486L,S:F490Y,S:E583D,S:P631S,S:V642G,S:T676N,S:N679R,S:E725D,S:D796H,S:H1101Q,S:D1139N,S:G1219C
cov-spectrum.org/explore/Worl...
+ S:C15Y,S:W64L,S:G72V,S:T95I,S:I101T,S:H146K,S:W152C,S:S172F,S:L176-,S:M177-,S:D178-,S:D215H,S:L242-,S:A243-,S:G446N,S:F486L,S:F490Y,S:E583D,S:P631S,S:V642G,S:T676N,S:N679R,S:E725D,S:D796H,S:H1101Q,S:D1139N,S:G1219C
cov-spectrum.org/explore/Worl...
April 7, 2025 at 3:05 AM
HP.1.1 Alias of XBB.1.5.55.1.1
+ S:C15Y,S:W64L,S:G72V,S:T95I,S:I101T,S:H146K,S:W152C,S:S172F,S:L176-,S:M177-,S:D178-,S:D215H,S:L242-,S:A243-,S:G446N,S:F486L,S:F490Y,S:E583D,S:P631S,S:V642G,S:T676N,S:N679R,S:E725D,S:D796H,S:H1101Q,S:D1139N,S:G1219C
cov-spectrum.org/explore/Worl...
+ S:C15Y,S:W64L,S:G72V,S:T95I,S:I101T,S:H146K,S:W152C,S:S172F,S:L176-,S:M177-,S:D178-,S:D215H,S:L242-,S:A243-,S:G446N,S:F486L,S:F490Y,S:E583D,S:P631S,S:V642G,S:T676N,S:N679R,S:E725D,S:D796H,S:H1101Q,S:D1139N,S:G1219C
cov-spectrum.org/explore/Worl...
XEC>ORF1b:T310I>N:T379I>S:N1187T(48 seq, 6country)
cov-spectrum.org/explore/Worl...
Spainで結構古くから存在する(2024-11)
SpainとWales以外は消滅してそうだけどこの二か所で再開しつつある
nextstrain.org/fetch/genome...
cov-spectrum.org/explore/Worl...
Spainで結構古くから存在する(2024-11)
SpainとWales以外は消滅してそうだけどこの二か所で再開しつつある
nextstrain.org/fetch/genome...
April 3, 2025 at 6:59 AM
XEC>ORF1b:T310I>N:T379I>S:N1187T(48 seq, 6country)
cov-spectrum.org/explore/Worl...
Spainで結構古くから存在する(2024-11)
SpainとWales以外は消滅してそうだけどこの二か所で再開しつつある
nextstrain.org/fetch/genome...
cov-spectrum.org/explore/Worl...
Spainで結構古くから存在する(2024-11)
SpainとWales以外は消滅してそうだけどこの二か所で再開しつつある
nextstrain.org/fetch/genome...
Orange Marmalade
BA.2.86のレベルが7だったことが判明(表示は6)
BA.2.86系統のバリアントを全て手動コピペで1レベル上げる修正が必要に
誰も気にしてないこの表示の修正に何時間かかるんだろうか…
SARS-CoV-2(doropfan
docs.google.com/spreadsheets...
BA.2.86のレベルが7だったことが判明(表示は6)
BA.2.86系統のバリアントを全て手動コピペで1レベル上げる修正が必要に
誰も気にしてないこの表示の修正に何時間かかるんだろうか…
SARS-CoV-2(doropfan
docs.google.com/spreadsheets...
April 1, 2025 at 10:00 AM
Orange Marmalade
BA.2.86のレベルが7だったことが判明(表示は6)
BA.2.86系統のバリアントを全て手動コピペで1レベル上げる修正が必要に
誰も気にしてないこの表示の修正に何時間かかるんだろうか…
SARS-CoV-2(doropfan
docs.google.com/spreadsheets...
BA.2.86のレベルが7だったことが判明(表示は6)
BA.2.86系統のバリアントを全て手動コピペで1レベル上げる修正が必要に
誰も気にしてないこの表示の修正に何時間かかるんだろうか…
SARS-CoV-2(doropfan
docs.google.com/spreadsheets...
色のシミュレータ(FREE)が操作が簡単で便利すぎるお話
画像やスマホのカメラ映像をリアルタイムに変換してくれる。
asada.website/cvsimulator/
SARS-CoV-2(doropfanを試したところ背景に文字が同化して見えない箇所も無さそうなので一安心
docs.google.com/spreadsheets...
色を多用しているから前から気になってはいたものの、チェックの仕方が分からなかったので非常に助かった。
画像やスマホのカメラ映像をリアルタイムに変換してくれる。
asada.website/cvsimulator/
SARS-CoV-2(doropfanを試したところ背景に文字が同化して見えない箇所も無さそうなので一安心
docs.google.com/spreadsheets...
色を多用しているから前から気になってはいたものの、チェックの仕方が分からなかったので非常に助かった。
March 31, 2025 at 2:45 AM
色のシミュレータ(FREE)が操作が簡単で便利すぎるお話
画像やスマホのカメラ映像をリアルタイムに変換してくれる。
asada.website/cvsimulator/
SARS-CoV-2(doropfanを試したところ背景に文字が同化して見えない箇所も無さそうなので一安心
docs.google.com/spreadsheets...
色を多用しているから前から気になってはいたものの、チェックの仕方が分からなかったので非常に助かった。
画像やスマホのカメラ映像をリアルタイムに変換してくれる。
asada.website/cvsimulator/
SARS-CoV-2(doropfanを試したところ背景に文字が同化して見えない箇所も無さそうなので一安心
docs.google.com/spreadsheets...
色を多用しているから前から気になってはいたものの、チェックの仕方が分からなかったので非常に助かった。
March 30, 2025 at 7:40 PM
XBBも古い株になってきたね
GE.1 (Nextclade)
Alias for XBB.2.3.10.1
cov-spectrum.org/explore/Worl...
nextstrain.org/fetch/genome...
GE.1 (Nextclade)
Alias for XBB.2.3.10.1
cov-spectrum.org/explore/Worl...
nextstrain.org/fetch/genome...
March 17, 2025 at 12:17 AM
XBBも古い株になってきたね
GE.1 (Nextclade)
Alias for XBB.2.3.10.1
cov-spectrum.org/explore/Worl...
nextstrain.org/fetch/genome...
GE.1 (Nextclade)
Alias for XBB.2.3.10.1
cov-spectrum.org/explore/Worl...
nextstrain.org/fetch/genome...
March 10, 2025 at 1:44 AM