Lightnews — Scholar-powered news

Sylvain Prigent @sylvainprigent.bsky.social · Jul 11

Ce fut un tel plaisir de participer à l'organisation de ces JOBIM !
Encore merci à toute l'équipe d'organisation !

JOBIM 2025 @jobim2025.bsky.social · Jul 11

👏 Ca y est, #JOBIM2025 est officiellement fini !

Au nom de toute l'équipe, merci pour votre participation, et pour toutes ces discussions scientifiques intenses et stimulantes.
Merci aussi pour votre enthousiasme, votre bienveillance et tous ces rires échangés pendant la conférence.

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Photo de groupe prise avec les participants et participantes à JOBIM 2025.

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Plateforme Bordeaux Metabolome @bdxmetabolome.bsky.social · Jun 13

This morning, Cathleen presented results at the GPR-BPS general assembly, based on data acquired on our metabolomics platform. Great to see our work contributing to broader research efforts! #Metabolomics

Cathleen presenting phytochemical characterisation of a big diversity of plant species

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JOBIM 2025 @jobim2025.bsky.social · May 23

🌱 Le comité d'organisation de #JOBIM2025 remercie chaleureusement le GPR BPS pour son soutien au congrès qui se tiendra les 8-11 juillet à Bordeaux.

Vous ne connaissez pas le GPR BPS ? 🤔

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This link will take you to a page that’s not on LinkedIn

lnkd.in

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Société Française de BioInformatique @sfbi.fr · May 27

‼️ Rappel ‼️

📍 La SFBI propose 15 bourses de voyage pour @jobim2025.bsky.social !

ℹ️ Plus d'informations : www.sfbi.fr/blog/article...

📎 Dossier accessible en ligne : www.sfbi.fr/static/doc/S...

⏳ Soumission des dossiers du 15 mai au 5 juin 2025

✉️ Pour toutes questions : [email protected] 🙂

Société Française de BioInformatique @sfbi.fr · May 19

📍 La #SFBI propose deux types de #bourses pour les @jobim2025.bsky.social (jobim2025.labri.fr) qui auront lieu du 8 au 11 juillet 2025 à Bordeaux.

✉️ Pour toutes demandes d'informations, n'hésitez pas à prendre contact avec nous via [email protected] ‼️

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INRAE UMR1332 BFP @inrae-bfp.bsky.social · May 21

Quelques 📸 des Journées Jeunes Chercheur·e·s du département BAP, à Bordeaux 14-16 mai
Organisées par un comité local, elles ont permis de mettre en valeur les travaux scientifiques des doctorant·e·s et postdoc via des présentations orales, posters, échanges scientifiques et moments de convivialité 👏

the picture above is the group of researchers, PhD students and postdocs who organized the conference. They are in the room where the conference was held and in the background there is a slide with the conference title.
The bottom picture is a group picture of all the participants standing in front of the Institute for Grape and Wine Sciences.

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Loic Lepiniec @lepiniec.bsky.social · Apr 27

plants.peercommunityin.org, new Peer Community In .. PLANTS !

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INRAE_France @inrae-france.bsky.social · Apr 16

Coup de projecteur sur des projets en rupture et à haut risque du programme EXPLOR’AE
✔️39 idées exploration et 5 projets transformation déjà financés #France2030
Des hypothèses originales pour des innovations de rupture, des recherches qui sortent des sentiers battus !
url.inrae.fr/44ySyng

EXPLOR’AE : INRAE dévoile des projets de recherche en rupture et à haut risque

DOSSIER DE PRESSE - Le programme France 2030 « Accélération de la recherche à risque en Agriculture, Alimentation et Environnement » EXPLOR’AE offre un cadre inédit pour soutenir des projets de recher...

url.inrae.fr

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Loïc @lolopops.bsky.social · Apr 18

Interesting critique in Nature Metabolism on misusing gene-centric tools for #metabolomics data 🧪.
Turns out metabolites ≠ genes🧬—and forcing them into gene-style pathway analysis can really skew results! Worth a read if you're into #systems-biology or #bioinformatics.
🔗 doi.org/10.1038/s422...

Metabolites are not genes — avoiding the misuse of pathway analysis in metabolomics - Nature Metabolism

Pathway analysis, originally developed for gene expression data, has been adapted for metabolomics. However, owing to the unique characteristics and constraints of metabolites compared with genes, pat...

doi.org

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Sylvain Prigent @sylvainprigent.bsky.social · Apr 8

We're hiring!
We're looking for a postdoc in systems biology with a focus on metabolic modeling
Great science, great people and a great place to work (yes, I’m biased)
The position will be co-supervised by the brilliant @cfrioux.bsky.social
Details&application: recrutement.inria.fr/public/class...

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Sylvain Prigent @sylvainprigent.bsky.social · Apr 1

Je veux en être !

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JOBIM 2025 @jobim2025.bsky.social · Mar 26

Dans moins d'une semaine, l'appel à soumissions pour #JOBIM2025 sera fini ‼️

🕛 Pour rappel, vous avez jusqu'au lundi 31 mars, à 23h59 (CET), pour nous partager vos travaux.

Alors bon courage à tou.te.s pour cette dernière ligne droite !

JOBIM 2025 @jobim2025.bsky.social · Feb 3

❗❗BREAKING NEWS❗❗

Les soumissions pour #JOBIM2025 sont ouvertes ! 😱
💡Articles longs, posters, démos, etc ; de nombreux formats sont attendus.

Les consignes détailles seront accessibles sur le site de #JOBIM2025 ➡️ jobim2025.labri.fr

⏳ Les soumissions fermeront le 31 mars, alors faîtes vite !

Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques - 2025

jobim2025.labri.fr

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INRAE UMR1332 BFP @inrae-bfp.bsky.social · Mar 27

Aujourd'hui Coralie de #meta présentait son sujet de doctorat dans MT180
Trois minutes de présentation pour nous apprendre comment Batman et elle-même peuvent utiliser les réseaux métaboliques pour sauver le monde !

Coralie devant sa slide de présentation divisée en deux, la partie gauche la représentant accompagnée de son chat en train d'étudier une carte du métabolisme
La partie droite représente Batman et Robin devant une carte des crimes de Gotham
En travaillant ensemble ils vont sauver le monde !

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Sylvain Prigent @sylvainprigent.bsky.social · Mar 27

N'oubliez pas, la finale de #mt180 à Bordeaux c'est aujourd'hui !
Venez notamment entendre parler de réseaux métaboliques et de métabolomique !

Université de Bordeaux @univbordeaux.bsky.social · Mar 26

#Agenda 📅 La finale du concours @univbordeaux.bsky.social @mt180fr.bsky.social , c'est demain à partir de 13h30 : 18 candidats, qui auront 3 minutes pour se qualifier pour la finale régionale qui aura lieu le 10/04 à @univ-larochelle.fr ! Retransmission en direct sur YouTube
www.u-bordeaux.fr/ev...

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Pint of Science FR @pintofscience.fr · Mar 19

✨ PLUS QUE DEUX MOIS avant #pint25 ✨

📍 +55 villes, du Parc naturel du Limousin à la Réunion et la Guyane
🔬 Des centaines de scientifiques passionné·e·s
🫂 500 organisateurs·trices à fond !

📱 Programme : 31 mars
🎟 Tickets : 14 avril
👉 pintofscience.fr

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Société Française de BioInformatique @sfbi.fr · Mar 4

Juste un petit rappel au cas où ... mais la deadline des #soumissions pour #JOBIM2025 c'est dans quelques jours ... ⏲️ Ce serait dommage de la louper 😃 On a hâte de voir les travaux de la communauté 🤓

Société Française de BioInformatique @sfbi.fr · Feb 3

🥁 Les #soumissions pour #JOBIM2025 sont officiellement ouvertes !! Vous avez jusqu'au 31 mars pour soumettre vos travaux. On a hâte !! 🤓

JOBIM 2025 @jobim2025.bsky.social · Feb 3

❗❗BREAKING NEWS❗❗

Les soumissions pour #JOBIM2025 sont ouvertes ! 😱
💡Articles longs, posters, démos, etc ; de nombreux formats sont attendus.

Les consignes détailles seront accessibles sur le site de #JOBIM2025 ➡️ jobim2025.labri.fr

⏳ Les soumissions fermeront le 31 mars, alors faîtes vite !

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Science Magazine @science.org · Jan 30

Exclusive: NSF this week began to search through billions of dollars of grants the agency has already awarded for anything touching on topics that President Donald Trump has criticized. And NSF has blocked grantees and trainees from accessing funds while the review is underway. scim.ag/3El0NZh

EXCLUSIVE: NSF starts vetting all grants to comply with Trump’s orders

Grantee accounts remain frozen, while union accuses NSF of ignoring rules governing peer review

scim.ag

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JOBIM 2025 @jobim2025.bsky.social · Jan 21

➡️ M Björn GRÜNING sera #keynote speaker à #JOBIM2025

Il nous vient d'Allemagne, du département d'Informatique de l'Université de Freiburg.

💡 Si les workflows, la reproductiblité et la science ouverte vous intéressent, venez l'écouter et le rencontrer en Juillet à Bordeaux, pour #JOBIM2025 !

"Workflows, reproductibilité et science ouverte" est le premier domaine tiré au sort !

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JOBIM 2025 @jobim2025.bsky.social · Jan 22

➡️ Mme Emma Schymanski sera #keynote speaker à #JOBIM2025

Emma nous vient du Centre pour la Biomédecine Systémique de l'Université du Luxembourg.

📊 Si les statistiques, le traitement ou l'intégration de données métabolomiques vous intéressent, rendez-vous en Juillet à Bordeaux, pour #JOBIM2025 !

"Traitement et intégration des données en métabolomique, et statistiques" est le second domaine tiré au sort !

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JOBIM 2025 @jobim2025.bsky.social · Jan 23

➡️ M Eric Rivals sera #keynote speaker à #JOBIM2025 !

Eric mène sa recherche au Laboratoire d'Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier.

🧬 Si le développement de méthodes et d'algorithmes pour les séquences vous intéresse, rendez-vous en Juillet à Bordeaux pour #JOBIM2025 !

"Méthodes et algorithmes pour les séquences" est le troisième domaine tiré au sort !

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JOBIM 2025 @jobim2025.bsky.social · Jan 27

➡️ M Jean Monlong sera #keynote speaker à #JOBIM2025 !

Il travaille à l'Institut de Recherche en Santé Digestive de Toulouse.

💊 Si la génomique fonctionnelle et intégrative vous intéresse, ne manquez pas de l'écouter et de le rencontrer en Juillet à Bordeaux pour #JOBIM2025 !

"Génomique fonctionnelle et intégrative" est le quatrième domaine tiré au sort !

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JOBIM 2025 @jobim2025.bsky.social · Jan 28

➡️ Mme Anamaria NECSULEA sera #keynote speaker à #JOBIM2025 !

Anamaria travaille au Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive de Lyon.

🐒 Si la génomique évolutive et la phylogénie vous intéressent, ne manquez pas de l'écouter et de la rencontrer en Juillet à Bordeaux, pour #JOBIM2025 !

"Génomique évolutive et phylogénie" est le cinquième domaine tiré au sort !

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Plateforme Bordeaux Metabolome @bdxmetabolome.bsky.social · Jan 14

Meet Maggot: a web-based tool for managing and sharing research metadata! It simplifies dataset organization, FAIR compliance, and collaborative metadata creation, enabling efficient sharing and documentation. #FAIRdata #OpenScience
doi.org/10.1093/giga...

An ecosystem for producing and sharing metadata within the web of FAIR Data

AbstractBackground. Descriptive metadata are vital for reporting, discovering, leveraging, and mobilizing research datasets. However, resolving metadata is

doi.org

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JOBIM 2025 @jobim2025.bsky.social · Nov 29

L'appel à proposition pour les mini #symposiums de #JOBIM2025 est lancé !!

Un mini-symposium:
➡️ réunit des scientifiques autour d'une thématique spécialisée en #bioinformatique 🗣️
➡️ dure 3 heures ⌚

⌛Attention, vous avez jusqu'au Vendredi 17 Janvier 2025 à 18h pour nous envoyer vos propositions!

Société Française de BioInformatique @sfbi.fr · Nov 28

📢 Appel à propositions pour les mini #symposiums pour @jobim2025.bsky.social
➡️ deadline : 17/01/2025 18h
➡️ objectif : réunir des scientifiques autour de thématiques spécialisées en #bioinformatique
➡️ durée : 3 heures
➡️ autofinancement (enveloppe de soutien possible via la #SFBI)

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Plateforme Bordeaux Metabolome @bdxmetabolome.bsky.social · Oct 18

Bordeaux Metabolome was well-represented at the 13th Metabohub Scientific Days! Theoretical insights and practical sessions were engaging and insightful. It was wonderful to meet in person after so many virtual meetings!

A photomontage displaying presentations about Microfluidics, Machine-learning, data contextualisation in plant science and multiscale metabolomics

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JOBIM 2025 @jobim2025.bsky.social · Sep 30

🍂 Septembre touche déjà à sa fin... 🍃
Contrairement à nos efforts pour préparer un super JOBIM 2025 ! 🎉
Alors vous aussi, préparez-vous pour l'évènement annuel de la bioinformatique française, et marquez dès maintenant dans vos agendas qu'il aura lieu à Bordeaux du 8 au 11 juillet 2025 !

Un message du comité d'organisation de JOBIM 2025 est sorti d'une enveloppe qui vous est destinée.

Le message est un SAVE THE DATE; il indique que JOBIM 2025 aura lieu à Bordeaux du 8 au 11 juillet 2025.

Il rappelle que JOBIM est un évènement annuel fédérateur de la bioinformatique française, et qu'il réunit chercheurs, ingénieurs et étudiants pour présenter de nouveaux outils et approches, ainsi que leur applications sur des données biologiques. Le tout, dans une ambiance chaleureuse aux côtés des acteurs français de la bioinformatiques.

Alors, pensez-bien à marquer ces dates! Du 8 au 11 juillet 2025, à Bordeaux.

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