マップって言葉がややこしかったですね…すみません
地図につけたマーカーがそのままになってたって感じです！
多分唯一残ってるファイルがそれ関連なんでしょうね…

可能性としてはファイル名や拡張子が変わって読み込めないとかでしょうか
管理の方にロールバック？の依頼しつつ、隠しファイル探したりlsコマンド入れてみたりして様子見でしょうかね…

取り急ぎデータが残ってた時間帯をメモっとくのが良いかもですね
少なくとも今日の昼ぐらいは残ってたと思います

キャラ作成してみるとマップのデータは消える前と同じみたいなので、完全に消えてるわけではなさそうですね

ちなみにbackupフォルダには似たようなファイルはなさそうですか？