例えば「特定の作品において登録商標を登録商標と明示せずに表示した際に、登録商標が普通名称化することを避ける目的で、当該作品における表示を取り止めるよう当該商標の権利者から連絡を受けた」という事例がたまにあるようなのだが、おそらく校閲はこのことを指摘してしまったんじゃないかと思われる。
ただ、まったくの造語ならまだしも、既存の語を商標登録しておいてそこまで神経質になる権利者はあまりいないだろうし、そも作品内で登録商標を表示することは商標権侵害でもなんでもないので、今回のケースに限って言えば全く気にしないでいいと思う。