Pierre Poulain
@pierrepo.bsky.social
Associate prof Univ Paris Cité & Laboratory of Theoretical Biochemistry
#bioinformatics #python #unix
#openscience Software Heritage ambassador
#pedagogy
#bioinformatics #python #unix
#openscience Software Heritage ambassador
#pedagogy
Reposted by Pierre Poulain
Oyez oyez, c'est le retour des podcasts de @next.ink !
Après les séries Algorithmique et Écosystème, je lance Entre la chaise et le clavier, un rendez-vous dans lequel on écoutera des chercheuses, penseurs, entrepeneures et citoyens expliquer comment ils s'emparent des sujets technologiques.
Après les séries Algorithmique et Écosystème, je lance Entre la chaise et le clavier, un rendez-vous dans lequel on écoutera des chercheuses, penseurs, entrepeneures et citoyens expliquer comment ils s'emparent des sujets technologiques.
November 26, 2025 at 5:44 PM
Oyez oyez, c'est le retour des podcasts de @next.ink !
Après les séries Algorithmique et Écosystème, je lance Entre la chaise et le clavier, un rendez-vous dans lequel on écoutera des chercheuses, penseurs, entrepeneures et citoyens expliquer comment ils s'emparent des sujets technologiques.
Après les séries Algorithmique et Écosystème, je lance Entre la chaise et le clavier, un rendez-vous dans lequel on écoutera des chercheuses, penseurs, entrepeneures et citoyens expliquer comment ils s'emparent des sujets technologiques.
Reposted by Pierre Poulain
8️⃣9️⃣ Charlotte Truchet @chtruchet.bsky.social (1974- ) 🇫🇷 #womeninSTEM Professor in computer science at Sorbonne University. She specialises in constraint programming. She campaigns for gender equality and explains computer science for the general public.
www.normalesup.org/~truchet/
www.normalesup.org/~truchet/
November 24, 2025 at 2:22 PM
8️⃣9️⃣ Charlotte Truchet @chtruchet.bsky.social (1974- ) 🇫🇷 #womeninSTEM Professor in computer science at Sorbonne University. She specialises in constraint programming. She campaigns for gender equality and explains computer science for the general public.
www.normalesup.org/~truchet/
www.normalesup.org/~truchet/
Reposted by Pierre Poulain
How to convert your Notion data to durable local files using Obsidian Importer:
help.obsidian.md/import/notion
help.obsidian.md/import/notion
Import from Notion - Obsidian Help
Obsidian lets you easily migrate your notes from Notion using the Importer plugin. This will convert your Notion data to durable Markdown files that you can use offline with Obsidian and many other a…
help.obsidian.md
November 22, 2025 at 9:08 PM
How to convert your Notion data to durable local files using Obsidian Importer:
help.obsidian.md/import/notion
help.obsidian.md/import/notion
Reposted by Pierre Poulain
🎮 THIS IS A CALL FOR RETRO-GAMERS! 🎮
Alex Pilot, director and co-founder of the legendary French geek TV channel Nolife, needs your help RIGHT NOW for his new indie film project — a movie set in the world of 90s demo makers on Amiga & Atari ST! 💾✨
Alex Pilot, director and co-founder of the legendary French geek TV channel Nolife, needs your help RIGHT NOW for his new indie film project — a movie set in the world of 90s demo makers on Amiga & Atari ST! 💾✨
November 7, 2025 at 7:43 PM
🎮 THIS IS A CALL FOR RETRO-GAMERS! 🎮
Alex Pilot, director and co-founder of the legendary French geek TV channel Nolife, needs your help RIGHT NOW for his new indie film project — a movie set in the world of 90s demo makers on Amiga & Atari ST! 💾✨
Alex Pilot, director and co-founder of the legendary French geek TV channel Nolife, needs your help RIGHT NOW for his new indie film project — a movie set in the world of 90s demo makers on Amiga & Atari ST! 💾✨
Reposted by Pierre Poulain
In case you're still looking for a gift idea for your PhD students, I made a tutorial on how to sew a tote bag in a fabric poster. It's in french but I'm sure you're all smart enough to get it.
C'est la saison des thèses et vous ne savez pas quoi offrir aux futur·e·s docteur·e·s de votre laboratoire ?
Sachez que vous pouvez recycler leurs posters (textiles) en tote bag et en plus je vous ai fait un tuto !
Sachez que vous pouvez recycler leurs posters (textiles) en tote bag et en plus je vous ai fait un tuto !
November 22, 2025 at 5:41 PM
In case you're still looking for a gift idea for your PhD students, I made a tutorial on how to sew a tote bag in a fabric poster. It's in french but I'm sure you're all smart enough to get it.
Reposted by Pierre Poulain
Un grand merci à @natachatriou.bsky.social pour nous avoir reçu dans l'émission #SciencesCQFD sur @franceculture.fr pour discuter des usages des supercalculateurs.
@sorbonne-universite.fr / @cnrs.fr
@qubit-pharma.bsky.social
www.radiofrance.fr/francecultur...
@sorbonne-universite.fr / @cnrs.fr
@qubit-pharma.bsky.social
www.radiofrance.fr/francecultur...
Supercalculateurs : droit au bit
Depuis quelques années, on entend beaucoup parler de ”supercalculateurs”. Mais ces géants silencieux ont toujours fait partie de l’histoire de l’informatique, et la guerre de clochers à laquelle on as...
www.radiofrance.fr
November 22, 2025 at 3:24 PM
Un grand merci à @natachatriou.bsky.social pour nous avoir reçu dans l'émission #SciencesCQFD sur @franceculture.fr pour discuter des usages des supercalculateurs.
@sorbonne-universite.fr / @cnrs.fr
@qubit-pharma.bsky.social
www.radiofrance.fr/francecultur...
@sorbonne-universite.fr / @cnrs.fr
@qubit-pharma.bsky.social
www.radiofrance.fr/francecultur...
Reposted by Pierre Poulain
Congratulations Dr. @marienj.bsky.social for your brillant defense, and your amazing thesis! 🎉
November 21, 2025 at 4:02 PM
Congratulations Dr. @marienj.bsky.social for your brillant defense, and your amazing thesis! 🎉
Reposted by Pierre Poulain
Reposted by Pierre Poulain
Tired of searching across a dozen different databases to find what you need? Do you wish you could #meta-search across all domains at once?
Join the LUMEN workshops that target researchers from #Mathematics, #EarthSystemScience, #MolecularDynamics & #SSH.
Sign up here: https://ow.ly/APpz50Xsz0I
Join the LUMEN workshops that target researchers from #Mathematics, #EarthSystemScience, #MolecularDynamics & #SSH.
Sign up here: https://ow.ly/APpz50Xsz0I
November 20, 2025 at 9:30 AM
Tired of searching across a dozen different databases to find what you need? Do you wish you could #meta-search across all domains at once?
Join the LUMEN workshops that target researchers from #Mathematics, #EarthSystemScience, #MolecularDynamics & #SSH.
Sign up here: https://ow.ly/APpz50Xsz0I
Join the LUMEN workshops that target researchers from #Mathematics, #EarthSystemScience, #MolecularDynamics & #SSH.
Sign up here: https://ow.ly/APpz50Xsz0I
Reposted by Pierre Poulain
Check the list of confirmed speakers for the MDDB Conference and apply to be part of this excellent lineup ➡️ mddbr.eu/conference/
Present your work, connect with leading experts from the community, and be part of the discussions shaping the future of MD research!
#MDDB #FAIRdata
Present your work, connect with leading experts from the community, and be part of the discussions shaping the future of MD research!
#MDDB #FAIRdata
November 20, 2025 at 10:43 AM
Check the list of confirmed speakers for the MDDB Conference and apply to be part of this excellent lineup ➡️ mddbr.eu/conference/
Present your work, connect with leading experts from the community, and be part of the discussions shaping the future of MD research!
#MDDB #FAIRdata
Present your work, connect with leading experts from the community, and be part of the discussions shaping the future of MD research!
#MDDB #FAIRdata
Reposted by Pierre Poulain
📌 Appel à propositions pour les mini-#symposia à #JOBIM2026
📅 #JOBIM aura lieu à Strasbourg du 30/06 au 3/07/26
ℹ️ Sessions thématiques afin de favoriser les échanges autour de sujets émergents, interdisciplinaires ou particulièrement dynamiques en #bioinformatique et #biologie #computationnelle
📅 #JOBIM aura lieu à Strasbourg du 30/06 au 3/07/26
ℹ️ Sessions thématiques afin de favoriser les échanges autour de sujets émergents, interdisciplinaires ou particulièrement dynamiques en #bioinformatique et #biologie #computationnelle
November 19, 2025 at 7:38 PM
📌 Appel à propositions pour les mini-#symposia à #JOBIM2026
📅 #JOBIM aura lieu à Strasbourg du 30/06 au 3/07/26
ℹ️ Sessions thématiques afin de favoriser les échanges autour de sujets émergents, interdisciplinaires ou particulièrement dynamiques en #bioinformatique et #biologie #computationnelle
📅 #JOBIM aura lieu à Strasbourg du 30/06 au 3/07/26
ℹ️ Sessions thématiques afin de favoriser les échanges autour de sujets émergents, interdisciplinaires ou particulièrement dynamiques en #bioinformatique et #biologie #computationnelle
Reposted by Pierre Poulain
L’Université Paris-Saclay et le MESRE organisent conjointement les Assises Nationales des données de la recherche.
➡️ Les problématiques de traitement des données sensibles, de réutilisation des données & l’IA seront au programme.
📅 1 & 2 décembre 2025
📍 ENS Paris-Saclay
🔗 tinyurl.com/4hhjjpb7
➡️ Les problématiques de traitement des données sensibles, de réutilisation des données & l’IA seront au programme.
📅 1 & 2 décembre 2025
📍 ENS Paris-Saclay
🔗 tinyurl.com/4hhjjpb7
November 19, 2025 at 8:23 AM
L’Université Paris-Saclay et le MESRE organisent conjointement les Assises Nationales des données de la recherche.
➡️ Les problématiques de traitement des données sensibles, de réutilisation des données & l’IA seront au programme.
📅 1 & 2 décembre 2025
📍 ENS Paris-Saclay
🔗 tinyurl.com/4hhjjpb7
➡️ Les problématiques de traitement des données sensibles, de réutilisation des données & l’IA seront au programme.
📅 1 & 2 décembre 2025
📍 ENS Paris-Saclay
🔗 tinyurl.com/4hhjjpb7
Reposted by Pierre Poulain
Excited to announce a new bqtools tutorial on sandbox.bio by @noamteyssier.bsky.social! Learn about the BINSEQ file format, and how it can replace FASTQ files for better data compression and faster parallel processing: sandbox.bio/tutorials/bq...
Efficient sequence analysis with bqtools
Interactive bqtools tutorial: learn to analyse sequence data efficiently with BINSEQ files using a command-line interface in your browser.
sandbox.bio
November 18, 2025 at 8:35 PM
Excited to announce a new bqtools tutorial on sandbox.bio by @noamteyssier.bsky.social! Learn about the BINSEQ file format, and how it can replace FASTQ files for better data compression and faster parallel processing: sandbox.bio/tutorials/bq...
Reposted by Pierre Poulain
Me at Cloudflare making sure OpenAI stays down:
November 18, 2025 at 1:25 PM
Me at Cloudflare making sure OpenAI stays down:
Reposted by Pierre Poulain
I recently discovered Conventional Comments (conventionalcomments.org) for providing a pseudo-standard set of labels for feedback and just tried it for an article review and it was really helpful to specify issues vs. thoughts vs. suggestions, etc. Hopefully it's helpful for the authors too!
November 17, 2025 at 3:52 PM
I recently discovered Conventional Comments (conventionalcomments.org) for providing a pseudo-standard set of labels for feedback and just tried it for an article review and it was really helpful to specify issues vs. thoughts vs. suggestions, etc. Hopefully it's helpful for the authors too!
Reposted by Pierre Poulain
Secure your spot for the workshop on the LUMEN #chatbot!
What kind of AI companion do you need to support you with your research? Let us know by joining us on Wednesday or Friday of this week.
Register here:
https://ow.ly/WNlQ50XsyQ5
What kind of AI companion do you need to support you with your research? Let us know by joining us on Wednesday or Friday of this week.
Register here:
https://ow.ly/WNlQ50XsyQ5
November 17, 2025 at 10:30 AM
Secure your spot for the workshop on the LUMEN #chatbot!
What kind of AI companion do you need to support you with your research? Let us know by joining us on Wednesday or Friday of this week.
Register here:
https://ow.ly/WNlQ50XsyQ5
What kind of AI companion do you need to support you with your research? Let us know by joining us on Wednesday or Friday of this week.
Register here:
https://ow.ly/WNlQ50XsyQ5
Reposted by Pierre Poulain
Voici notre 6ème épisode de Qrieux, la série:
ADN sous tension : condition essentielle à sa réparation
Avec Chantal Prévost, Afra Sabei et Mara Prentiss (IBPC), Paris, France.
Qrieuz, la série met en valeur les recherches des scientifiques de @pslqlife.bsky.social.
#scicomm
ouvaton.link/Azp8fQ
ADN sous tension : condition essentielle à sa réparation
Avec Chantal Prévost, Afra Sabei et Mara Prentiss (IBPC), Paris, France.
Qrieuz, la série met en valeur les recherches des scientifiques de @pslqlife.bsky.social.
#scicomm
ouvaton.link/Azp8fQ
Qrieux, la série - Episode 6 - ADN sous tension : condition essentielle à sa réparation
Enjoy the videos and music you love, upload original content, and share it all with friends, family, and the world on YouTube.
ouvaton.link
November 12, 2025 at 9:30 PM
Voici notre 6ème épisode de Qrieux, la série:
ADN sous tension : condition essentielle à sa réparation
Avec Chantal Prévost, Afra Sabei et Mara Prentiss (IBPC), Paris, France.
Qrieuz, la série met en valeur les recherches des scientifiques de @pslqlife.bsky.social.
#scicomm
ouvaton.link/Azp8fQ
ADN sous tension : condition essentielle à sa réparation
Avec Chantal Prévost, Afra Sabei et Mara Prentiss (IBPC), Paris, France.
Qrieuz, la série met en valeur les recherches des scientifiques de @pslqlife.bsky.social.
#scicomm
ouvaton.link/Azp8fQ
Reposted by Pierre Poulain
LUMEN partner PCSS has released a podcast episode on LUMEN!
Find more info on where to listen to the podcast in Polish and, if needed, with subtitles on the LUMEN website: https://lumenproject.eu/pcss-releases-podcast-episode-on-lumen/
Find more info on where to listen to the podcast in Polish and, if needed, with subtitles on the LUMEN website: https://lumenproject.eu/pcss-releases-podcast-episode-on-lumen/
November 14, 2025 at 1:01 PM
LUMEN partner PCSS has released a podcast episode on LUMEN!
Find more info on where to listen to the podcast in Polish and, if needed, with subtitles on the LUMEN website: https://lumenproject.eu/pcss-releases-podcast-episode-on-lumen/
Find more info on where to listen to the podcast in Polish and, if needed, with subtitles on the LUMEN website: https://lumenproject.eu/pcss-releases-podcast-episode-on-lumen/
Reposted by Pierre Poulain
Find all the details and links to the databases in the preprint manuscript (doi.org/10.1101/2025...)
Uncovering the flexibility of CDR loops in antibodies and TCRs through large-scale molecular dynamics
Antibody structures are composed of framework regions that adopt a conserved fold and complementarity determining regions (CDR) loops which are far more variable. Flexibility of CDR loops has been lin...
doi.org
November 12, 2025 at 9:21 PM
Find all the details and links to the databases in the preprint manuscript (doi.org/10.1101/2025...)
Reposted by Pierre Poulain
My first full contribution from my time in @opig.stats.ox.ac.uk is now out! Together with @fspoendlin.bsky.social (and with contributions from King Ifashe), we created FlAbDab and FTCRDab: two large-scale, open molecular dynamics datasets to study flexibility in immune receptors.
November 12, 2025 at 9:21 PM
My first full contribution from my time in @opig.stats.ox.ac.uk is now out! Together with @fspoendlin.bsky.social (and with contributions from King Ifashe), we created FlAbDab and FTCRDab: two large-scale, open molecular dynamics datasets to study flexibility in immune receptors.
Reposted by Pierre Poulain
New diamond open access journal Replication Research welcomes reports of replication of previous works. #academicchatter
https://www.uni-muenster.de/Ejournals/index.php/replicationresearch/index
https://www.uni-muenster.de/Ejournals/index.php/replicationresearch/index
Replication Research
Replication Research is a diamond open-access and researcher-led journal that publishes reproductions, replications, and conceptual articles on repetitive research
www.uni-muenster.de
November 12, 2025 at 9:54 AM
New diamond open access journal Replication Research welcomes reports of replication of previous works. #academicchatter
https://www.uni-muenster.de/Ejournals/index.php/replicationresearch/index
https://www.uni-muenster.de/Ejournals/index.php/replicationresearch/index
Reposted by Pierre Poulain
Code decays. How do you save a 1989 video game or digital-native art? Conservator Nika Maltar explains her strategy for integrating community-driven FOSS preservation tools (like #SWHAP) into a museum workflow.
November 11, 2025 at 7:23 PM
Code decays. How do you save a 1989 video game or digital-native art? Conservator Nika Maltar explains her strategy for integrating community-driven FOSS preservation tools (like #SWHAP) into a museum workflow.
Reposted by Pierre Poulain
Bonjour à tous ! Je recherche un nouveau poste et vous serais reconnaissant de m‘apporter votre aide. Si vous entendez parler d’une opportunité ou si vous souhaitez simplement en discuter, envoyez-moi un message ou laissez un commentaire ci-dessous. J‘aimerais reprendre contact. #OpenToWork
#opentowork #data #bigdata #dataengineer #datastewart #datamanager #datascientist | Gabriel 🐱 Chandesris
Bonjour à tous ! Je recherche un nouveau poste et vous serais reconnaissant(e) de m‘apporter votre aide. Si vous entendez parler d’une opportunité ou si vous souhaitez simplement en discuter, envoyez-...
www.linkedin.com
November 11, 2025 at 3:48 PM
Bonjour à tous ! Je recherche un nouveau poste et vous serais reconnaissant de m‘apporter votre aide. Si vous entendez parler d’une opportunité ou si vous souhaitez simplement en discuter, envoyez-moi un message ou laissez un commentaire ci-dessous. J‘aimerais reprendre contact. #OpenToWork
Reposted by Pierre Poulain
📅 Le prochain tuto@mate c'est déjà lundi 17 novembre prochain à 14h
Au programme, Lucie Loubère nous expliquera comment "Entre[r] dans la lexicométrie avec le logiciel IRaMuTeQ". Le texte, oui, mais avec des chiffres ✏️🧮 !
ℹ️ mate-shs.cnrs.fr/actions/tuto...
Au programme, Lucie Loubère nous expliquera comment "Entre[r] dans la lexicométrie avec le logiciel IRaMuTeQ". Le texte, oui, mais avec des chiffres ✏️🧮 !
ℹ️ mate-shs.cnrs.fr/actions/tuto...
Entrez dans la lexicométrie avec le logiciel IRaMuTeQ - MATE-SHS
Lundi 17 novembre 2025, de 14h00 à 16h00 Par Lucie Loubère IRaMuTeQ est un logiciel libre d’analyse statistique de données textuelles. Développé par Pierre Ratinaud (Lerass), il s’appuie sur le logiciel R pour proposer des outils de textométrie comme le calcul de spécificités, les distances de Labbé et la classification hiérarchique descendante de type Reinert. … Continuer la lecture de Entrez dans la lexicométrie avec le logiciel IRaMuTeQ →
mate-shs.cnrs.fr
November 10, 2025 at 3:17 PM
📅 Le prochain tuto@mate c'est déjà lundi 17 novembre prochain à 14h
Au programme, Lucie Loubère nous expliquera comment "Entre[r] dans la lexicométrie avec le logiciel IRaMuTeQ". Le texte, oui, mais avec des chiffres ✏️🧮 !
ℹ️ mate-shs.cnrs.fr/actions/tuto...
Au programme, Lucie Loubère nous expliquera comment "Entre[r] dans la lexicométrie avec le logiciel IRaMuTeQ". Le texte, oui, mais avec des chiffres ✏️🧮 !
ℹ️ mate-shs.cnrs.fr/actions/tuto...
