Lightnews — Scholar-powered news

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 2d

✔︎ on Wednesday, October 8 at 12h : Resumption of all IFB services (website, ATLASea: atlas des génomes marins portal, ABRromics portal, Moodle training, Fair Checker, DSW, sandbox)
✔︎ on Friday, October 10 at 18h : Resumption of Cluster services (OnDemand, Usegalaxy, Community, My, ABRomics platform)

1

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 2d

🚨🚧🖥 As a reminder, the servers will be shut down today at 14h.🚨🚧🖥
Service is expected to resume :

1 1 2

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 6d

🦠💊Le projet #ABRomics, co-porté par l’IFB et l'Institut Pasteur, est soutenu par le PPR #Antibioresistance, piloté par l'Inserm, dans le cadre du plan d’investissement de l’État français, #France2030.

@cnrs.fr @cnrsbiologie.bsky.social @pasteur.fr @inserm.fr @inrae-france.bsky.social

1

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 6d

Au programme : préparation de l’interfaçage des données, mise en place de matrice de comparaison et de visualisations graphiques, intégration des premiers workflows dans Galaxy… À suivre !

1 2

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 6d

📣🚀💻 #Hackathon de l’équipe de dev d’ #ABRomics à Clermont-Ferrand ! Quelques jours intenses pour proposer encore plus de fonctionnalités sur la plateforme numérique dédiée à la surveillance génomique et la recherche sur l’antibiorésistance.

1 1 3

Reposted by IFB/ELIXIR-Fr

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 16d

🚨🚧UPDATE 📢 Wednesday, October 8 at 12h : Resumption of all IFB services (website, Atlasea portal, ABRromics portal, Moodle training, Fair Checker, DSW, sandbox)

Friday, October 10 at 18h : Resumption of Cluster services (OnDemand, Usegalaxy, Community, My, ABRomics platform)

1

Reposted by IFB/ELIXIR-Fr

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 20d

🚨📢🖥 Server maintenance 🖥📢🚨
🗓️ From 6 to 8 October 2025, the IFB's tools and websites (IFB, #ABRomics, DSW, Fair-checker, OnDemand, ...) will be unavailable due to the IDRIS #servers being shut down for #maintenance.
Thank you for your understanding !
#data #bioinformatique #cluster #cloud

1 4 2

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 8d

@cnrs-idf-villejuif.bsky.social @sfbi.fr @helenechiapello.bsky.social
@mthomaschollier.bsky.social @nlitb.bsky.social
@bebatut.bsky.social @fred2l.bsky.social @cnrsbiologie.bsky.social @ibisa.net @inserm.fr @inrae-france.bsky.social @jebif.bsky.social

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 8d

📢 L’IFB & iPOP-UP (EDC) organisent 3 jours de formation du 29/09 au 1/10 pour maîtriser les langages de #workflows #Snakemake & #Nextflow 🧬💻. Optimisez vos analyses bioinformatiques et assurez leur reproductibilité !
🔎https://urlr.me/597tKC

#Bioinfo #Formation #Cloud #Cluster

1 2 2

Reposted by IFB/ELIXIR-Fr

ELIXIR Europe @elixir-europe.org · 16d

✨ This Wednesday, ELIXIR is holding a webinar to explore the journey of #ELIXIR_Germany (denbi.bsky.social) – from its early beginnings to its current role as a key part of the European ELIXIR network.
📆 24 September 2025 🕒 15:00-16:00 CEST
Register now 👉 https://loom.ly/erUveaI

3 6

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 16d

🚨🚧UPDATE 📢 Wednesday, October 8 at 12h : Resumption of all IFB services (website, Atlasea portal, ABRromics portal, Moodle training, Fair Checker, DSW, sandbox)

Friday, October 10 at 18h : Resumption of Cluster services (OnDemand, Usegalaxy, Community, My, ABRomics platform)

1

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 20d

@cnrs-idf-villejuif.bsky.social @sfbi.fr @helenechiapello.bsky.social
@mthomaschollier.bsky.social @nlitb.bsky.social
@bebatut.bsky.social @fred2l.bsky.social @cnrsbiologie.bsky.social @ibisa.net @inserm.fr @inrae-france.bsky.social @jebif.bsky.social

1 1

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · 20d

🚨📢🖥 Server maintenance 🖥📢🚨
🗓️ From 6 to 8 October 2025, the IFB's tools and websites (IFB, #ABRomics, DSW, Fair-checker, OnDemand, ...) will be unavailable due to the IDRIS #servers being shut down for #maintenance.
Thank you for your understanding !
#data #bioinformatique #cluster #cloud

1 4 2

Reposted by IFB/ELIXIR-Fr

Claire @nlitb.bsky.social · 20d

Great to be here!
@ifb-elixir-fr.bsky.social

Bioconductor @bioconductor.bsky.social · 20d

EuroBioC2025 is in full swing here in Barcelona!

Day 1 was full of great talks, conversations, and that amazing Bioconductor community energy. Excited for what’s ahead today and tomorrow!

#EuroBioC2025 #Bioconductor #OpenScience #Community

EuroBioC2025 group photo on PRBB terrace with sea in background.

EuroBioC2025 welcome in PRBB auditorium by host Robert Castelo, showing slides with conference sticker and sponsor logos.

EuroBioC2025 hexwall banner with the hexwall creator Kevin Rue-Albrecht standing beside it.

EuroBioC2025 carved wooden keyring, a gift for all participants, created by Annekathrin Nedwed.

1 2

Reposted by IFB/ELIXIR-Fr

Claire @nlitb.bsky.social · 21d

First day of the 2025 European Bioconductor conference! 🙌🏻🇪🇸

📍PRBB, Barcelona, Spain
@bioconductor.bsky.social @ifb-elixir-fr.bsky.social

Conference opening slide presented in an auditorium

1 2 3

Reposted by IFB/ELIXIR-Fr

Bérénice Batut @bebatut.bsky.social · 28d

📄 New preprint!

After months/years of gathering insights and input from our incredible community, we're thrilled to share this important resource:
"Ten Common Misconceptions About Galaxy (and Why They Are Wrong!)" www.preprints.org/manuscript/2...

1 3 4

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · Jul 25

@cnrs-idf-villejuif.bsky.social @helenechiapello.bsky.social
@mthomaschollier.bsky.social @nlitb.bsky.social
@bebatut.bsky.social @fred2l.bsky.social @cnrsbiologie.bsky.social @ibisa.net @inserm.fr @inrae-france.bsky.social @jebif.bsky.social

1

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · Jul 25

📰💻 Vous n'avez pas encore lu notre article ? rendez-vous sur le site internet 👉 www.france-bioinformatique.fr/actualites/j...

Merci à tous pour cette belle édition, et encore merci au comité d'organisation et la Société Française de Bioinformatique SFBI ! 👏

JOBIM 2025 - Retour sur une belle édition à Bordeaux - IFB

www.france-bioinformatique.fr

1 1 1

IFB/ELIXIR-Fr @ifb-elixir-fr.bsky.social · Jul 25

✨ 📹 Pour se replonger encore un peu dans cette belle édition de JOBIM Bordeaux qui s'est déroulée début juillet, découvrez notre vidéo ! www.youtube.com/shorts/U2sPu...

L'IFB/ELIXIR-FR à JOBIM Bordeaux - Juillet 2025

YouTube video by French Institute of Bioinformatics

www.youtube.com

1 5 7

Reposted by IFB/ELIXIR-Fr

JOBIM 2025 @jobim2025.bsky.social · Jul 11

👏 Ca y est, #JOBIM2025 est officiellement fini !

Au nom de toute l'équipe, merci pour votre participation, et pour toutes ces discussions scientifiques intenses et stimulantes.
Merci aussi pour votre enthousiasme, votre bienveillance et tous ces rires échangés pendant la conférence.

1/2 ⤵️

Photo de groupe prise avec les participants et participantes à JOBIM 2025.

1 14 28

Reposted by IFB/ELIXIR-Fr

RSG France - JeBiF @jebif.bsky.social · Jul 10

Keynote de Björn Grüning à #JOBIM2025 : #Galaxy, plateforme et workflows clés pour une bioinfo ouverte, accessible et reproductible. #GalaxyProject #bioinfo

@ifb-elixir-fr.bsky.social @sfbi.fr @jobim2025.bsky.social

4 6

Reposted by IFB/ELIXIR-Fr

GenOuest @genouest.bsky.social · Jul 10

@abretaud.bsky.social and @bebatut.bsky.social presenting @galaxyproject.bsky.social France during the @ifb-elixir-fr.bsky.social network presentation at @jobim2025.bsky.social !

4 7

Reposted by IFB/ELIXIR-Fr

RSG France - JeBiF @jebif.bsky.social · Jul 9

Une vraie réussite pour les premiers #jobFAIR organisés par @jebif.bsky.social et la @sfbi.fr dans le cadre de @jobim2025.bsky.social 🎯

Une occasion unique de rencontrer des professionnels de la #bioinformatique 🧬

Rdv demain !

#JOBIM2025

3 7

Reposted by IFB/ELIXIR-Fr

RSG France - JeBiF @jebif.bsky.social · Jul 9

🗣️ Lundi matin, avant @jobim2025.bsky.social, Nous avons parlé #vulgarisation et bioinformatique avec des professionnels!

Merci aux intervenant·es pour leurs échanges inspirants et leurs conseils précieux pour la communauté 🙌

@sfbi.fr @ifb-elixir-fr.bsky.social
#JeBiF@JOBIM #JeBiF #JOBIM2025

2 5

Reposted by IFB/ELIXIR-Fr

Claire @nlitb.bsky.social · Jul 9

Visible sur HAL :)

hal.inrae.fr/hal-05142802v1

@ifb-elixir-fr.bsky.social @bioconductor.bsky.social

3 2