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URGI @urgi-inrae.bsky.social · 19d

We have made public the data from WP2 of the BreedWheat project. You can find this resources here wheat-urgi.versailles.inrae.fr/Projects/Bre... with the label WP2. You can find phenotyping data, genotyping data and association data.

BreedWheat - WHEAT URGI

Content Management System

wheat-urgi.versailles.inrae.fr

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Mariène Wan @marienewan.bsky.social · Jul 10

Venez me voir au poster 2, pour découvrir l'URGI, une plateforme bio-informatique @urgi-inrae.bsky.social
@jobim2025.bsky.social
#JOBIM2025 #URGI #INRAE

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Mariène Wan @marienewan.bsky.social · Jul 10

Venez découvrir #REPET, un outil de détection, de classification et d'annotation d'éléments transposables en live avec Etienne Bardet en amphi E @jobim2025.bsky.social

@urgi-inrae.bsky.social

#JOBIM2025 #URGI #INRAE

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Johann Confais @johannconfais.bsky.social · Jul 10

Vous êtes à #JOBIM2025 et vous avez manquez le poster de @marienewan.bsky.social sur la nouvelle version de #REPET ? Rassurez vous une demo est organisé aujourd'hui à midi en amphi E. Vous découvrirez toutes les évolutions mises en place pour vous faciliter l'annotation des #transposons

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URGI @urgi-inrae.bsky.social · Jun 24

ELIXIR has released a position paper on open biodata, more information here elixir-europe.org/news/positio... or here www.linkedin.com/posts/elixir...

ELIXIR position paper on securing open biodata resources for European competitiveness | ELIXIR

elixir-europe.org

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URGI @urgi-inrae.bsky.social · Apr 11

Check this interview wheatgenome.org/people/leade... on IWGSC website from our Deputy Director at URGI @michaelalaux.bsky.social. His thoughts on Wheat Genomics and bioinformatics on the last few years and for the future.

Michael Alaux

Michael Alaux is the Deputy Director of URGI (Unit Resources Genomics-Info) at the French National Research Institute for Agriculture, Food, and Environment (IN...

wheatgenome.org

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Clément Goubert @clementgoubert.bsky.social · Jan 14

The great @johannconfais.bsky.social on a reference-free approach (panREPET) to annotate #Transposons in #pangenomes 🧬

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URGI @urgi-inrae.bsky.social · Jan 14

Great presentation from @johannconfais.bsky.social at #PAG2025 #PAG32 on the first result obtained with panREPET tool a non reference centric approach

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Johann Confais @johannconfais.bsky.social · Jan 13

REPET got a complete overhaul in version 4.0 ! Etienne Bardet from @urgi-inrae.bsky.social presents the updates in #PAG32
forgemia.inra.fr/urgi-anagen/...

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Johann Confais @johannconfais.bsky.social · Jan 13

Great tall from @clementgoubert.bsky.social to present GraffiTE: a pipline that finds polymorphic TE in genomes
#PAG32
github.com/cgroza/Graff...

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URGI @urgi-inrae.bsky.social · Jan 13

Vanita Haurheeram will be present at #PAG2025 to introduce URGI service to FAIR research data management. Template, guidelines, repositories, data portals tool, come see her at
POSTER80

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URGI @urgi-inrae.bsky.social · Jan 13

Maud Marty will be present at #PAG2025 to introduce forest tree data in FAIDARE, a plant data discovery portal. You want to discover the forest tree data generated by the french community, let her guide you through the ecosystem

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Nicolas Francillonne @nico971.bsky.social · Jan 12

After @tehub.bsky.social satellite workshop at #ICTE2024 and the creation of a working group on benchmark, what about the next step ? A manual curation workshop ? Share your thougth with the TEhub

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Nicolas Francillonne @nico971.bsky.social · Jan 12

@johannconfais.bsky.social and @clementgoubert.bsky.social are presenting @tehub.bsky.social at #PAG2025, an amazing resource and driven community for anyone interested in transposable element

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Clément Goubert @clementgoubert.bsky.social · Jan 10

#PAG32 I'd bet that every genome studied at PAG has a least 1 #Transposon, if not thousands! Find us on Sunday for an exciting session on #mobileDNA!

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URGI @urgi-inrae.bsky.social · Jan 12

Great presentation from Michael Alaux in #BrAPI session #PAG2025, how the french community use BrAPI to share data between several tools

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URGI @urgi-inrae.bsky.social · Jan 6

URGI will be present at PAG 2025. We will talked about pangenomics, annotation tools, Data exchange and findability using BrAPI, Data management services, Forest tree data management, check the details here urgi.versailles.inrae.fr/About-us/New...

PAG 32 - URGI

Content Management System

urgi.versailles.inrae.fr

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Nicolas Francillonne @nico971.bsky.social · Sep 30

📣 #hiringalert #JobOpening Rejoignez-nous en tant qu'ingénieur en données agronomiques @INRAE_URGI
en CDD sur Versailles ou Toulouse. Info : jobs.inrae.fr/ot-22883 @INRAE_DPT_BAP
@INRAE_France

@INRAE_IDF
@INRAE_Tlse

@Bioinf0mics

@IFB_Bioinfo
@UnivParisSaclay
@SfbiFr

Ingénieur-e données agronomiques

L’URGI, unité INRAE de recherche en bioinformatique dédiée à la génomique et à la génétique des plantes, recherche un ingénieur en données agronomiques, en contrat CDD pour 12 mois renouvelable. La pe...

jobs.inrae.fr

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Nicolas Francillonne @nico971.bsky.social · Jul 11

C'est le moment de faire le bilan de ces 2 jours et de tracer la feuille de route pour l année à venir #BReIF #AgroDiv AgroBRC_RARe INRAE_URGI #France2030 Florilege, OLGA, IFB_Bioinfo @inrae-france.bsky.social #INRAE_DPT_BAP #INRAE_DPT_GA #INRAE_TOULOUSE

Nicolas Francillonne @nico971.bsky.social · Jul 10

C est parti pour l AG #PEPR à Toulouse pour les projets #AgroDiv et #BReIF. Ce 10 et 11 juillet, nous allons partager et discuter des avancées des projets #France2030 AgroBRC_RARe Florilege, IFB_Bioinfo @inrae-france.bsky.social INRAE_DPT_BAP INRAE_DPT_GA

Nicolas Francillonne @nico971.bsky.social · Jul 4

Et c est reparti, 2e journée de l atelier pangénomique
@inrae-france.bsky.social
à Versailles du SaPI PanAnnot #CATI_GREP
#CATI_BARIC @johannconfais.bsky.social
On discute des outils de pangénomique et de leur impact sur nos thématiques de travail.

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Johann Confais @johannconfais.bsky.social · May 10

We are happy to announce that the recording of the last
#TEhub
workshop on #benchmark at
#ICTE2024
is available on our YouTube channel! youtube.com/watch?v=3qY0... Please share widely! #Transposons #TEsky

Workshop: "developing benchmarks for TE research/bioinformatics" | ICTE24 | Saint-Malo, France

Complete video and audio recording (lightly edited for time) of the 2024 TE-Hub Workshop "TE Hub workshop: developing benchmarks for TE research/methods/tool...

youtube.com

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Nicolas Francillonne @nico971.bsky.social · Apr 20

#ICTE2024 is starting #TEworldwide, INRAE-URGI is here with @johannconfais.bsky.social Somia Saidi, Héléna Vassilieff and Etienne Bardet, come see our posters and discuss

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Johann Confais @johannconfais.bsky.social · Feb 23

📢 #hiringalert #JobOpening #Concours Rejoignez-nous en tant qu'ingénieur développeur de pipeline d'analyse et #DevOps @INRAE_URGI sur Versailles ou Toulouse. Plus d'info sur urgi.versailles.inrae.fr/About-us/News/… @inrae-france.bsky.social

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Nicolas Francillonne @nico971.bsky.social · Feb 21

📣 #hiringalert #JobOpening #Concours Rejoignez-nous en tant qu'ingénieur développeur de pipeline d'analyse et #DevOps @INRAE_URGI sur Versailles ou Toulouse. Plus d'info sur urgi.versailles.inrae.fr/About-us/New... @INRAE_DPT_BAP @INRAE_France @INRAE_IDF @INRAE_TLSE @BIOINFOMICS @IFB_Bioinfo

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