Lightnews — Scholar-powered news

Francois Sabot @francoissabot.bsky.social · 1h

Oui, un service basé sur NextCloud proposé aussi pour leurs membres par @ird-fr.bsky.social ou @inrae-france.bsky.social
Très pratique en ces temps de dépôts @agencerecherche.bsky.social d'ailleurs

Francois Sabot @francoissabot.bsky.social · 6d

Ah ben non, c'est un gallifréen, donc le Docteur

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Valérie Verdier @valerieverdier.bsky.social · 7d

Hier journée interCoSav 💡
Retour sur la mobilisation des #CoSav lors des grands moments internationaux
Riches échanges sur les perspectives de renforcement, le besoin d’appui, le dialogue sciences-politiques-société, pour nourrir les réflexions sur leur évolution & sur les sciences de la durabilité

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Valérie Verdier @valerieverdier.bsky.social · 10d

✨Très belle expo "Éclaireuses" d' @ird-fr.bsky.social avec #photoclimat #ONUFemmesFrance @agencerecherche.bsky.social @paris.fr
Portraits de femmes scientifiques de l'IRD et de ses partenaires👩‍🔬
L'IRD soutient une recherche inclusive & la formation des citoyen(ne)s de demain
👉12/10/25-Quais de Seine

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Francois Sabot @francoissabot.bsky.social · 9d

Avec plusieurs collègues du Collègue Logiciels de la recherche du Comité pour la Science Ouverte, nous avons produit un document de stratégie d'établissement pour al diffusion et la pérennité dans l'ESR. On revient sur les #opensoftware #openscience @ird-fr.bsky.social

dx.doi.org/10.52949/82

Quelles stratégies de diffusion et pérennité pour les logiciels de recherche dans les établissements publics français ?

Le présent document propose une analyse de la diffusion et de la pérennité des travaux scientifiques de type logiciel produits par les établissements de recherche français. Partant du constat qu’il n’...

dx.doi.org

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Francois Sabot @francoissabot.bsky.social · 12d

Fait

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Valérie Verdier @valerieverdier.bsky.social · 13d

Ravie d'avoir rencontré Clarisse Angelier, déléguée générale de l'ANRT: l'occasion d’aborder la collaboration de recherche public-privé, le dispositif CIFRE, son potentiel à l’international et de l'opportunité d'accroitre ce dispositif à l'@ird-fr.bsky.social

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Padre Pio @padrepio.bsky.social · 17d

Et je pense que pour un paquet d'entre nous, sa version du Faucheur nous aide à apaiser l'idée de la fin, celles des gens qu'on aime comme la nôtre.

Justine Breton @bretonjustine.bsky.social · 18d

💀 Le 9 octobre prochain paraîtra mon livre Terry Pratchett et la Mort : Mourir en majuscules (@edlatalante.bsky.social).
La mort est un sujet central dans l’œuvre et la vie de Pratchett, une évidence qu’il a longtemps cherché à comprendre et non à craindre.
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www.l-atalante.com/catalogue/la...

Terry Pratchett et la Mort : Mourir en majuscules | Éditions L'Atalante

C’EST BIEN DE LEURS COUPS, AUX MORTELS.ILS N’ONT QUE QUELQUES ANNÉES DEVANT EUX,ET ILS LES PASSENT À SE COMPLIQUER LA VIE.FASCINANT. PRENDS...

www.l-atalante.com

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Rita Rebollo @ritarebollo.bsky.social · 23d

Hi! We are looking for a PhD to work on the cross talk between transposable elements, insects and intracellular bacteria on the bioinformatics side. The PhD would be supervised by @mariefablet.bsky.social and myself along with @nicolasparisot.bsky.social Deadline December 2025! Please share! #tesky

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Javier Santoyo @jsantoyo.bsky.social · 25d

Deep genome sequencing reveals extensive genetic heterogeneity in early human placentas. #HumanPlacenta #PlacentaGenetics @natcomms.nature.com 🧬
www.nature.com/articles/s41...

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Francois Sabot @francoissabot.bsky.social · 29d

Really nice! Meaning that us scientists will not be removed by LLM, on the opposite of what said techbros :D

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Facundo Romani @fromani.bsky.social · Sep 9

🧬🌱 Excited to share our new preprint. Large effort by Fede, Manuel, Enzo, and other 112 plant biologists. In short, LLMs perform better on well-established knowledge from highly cited sources but struggle with cutting-edge research www.biorxiv.org/content/10.1... #plantscience

What Large Language Models Know About Plant Molecular Biology

Large language models (LLMs) are rapidly permeating scientific research, yet their capabilities in plant molecular biology remain largely uncharacterized. Here, we present MoBiPlant, the first compreh...

www.biorxiv.org

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DatNoFact @datnofact.bsky.social · Sep 3

Microsoft Word to begin saving people's documents in the cloud *by default*

Reminder that LibreOffice is free and a good drop-in replacement for Microsoft Office software: www.libreoffice.org

www.theverge.com/news/767522/...

Microsoft Word now automatically saves new documents to the cloud

Word documents will be automatically saved to OneDrive

www.theverge.com

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Rayan Chikhi @rayanchikhi.bsky.social · Sep 3

🌎👩‍🔬 For 15+ years biology has accumulated petabytes (million gigabytes) of🧬DNA sequencing data🧬 from the far reaches of our planet.🦠🍄🌵

Logan now democratizes efficient access to the world’s most comprehensive genetics dataset. Free and open.

doi.org/10.1101/2024...

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Sheila Roitman @sheilaroitman.bsky.social · Sep 2

How diverse are the individual strains within your species?
How broad is their Pangenome?
How will you choose representatives from the whole collection?

Look no further! PanGene-O-Meter is here for you!
From @haimashkenazy.bsky.social @plantevolution.bsky.social

www.biorxiv.org/content/10.1...

PanGene-O-Meter: Intra-Species Diversity Based on Gene-Content

Bacterial genome evolution is shaped to a great extent by horizontal gene transfer, detectable as genes with a presence-absence pattern of variation that does not follow phylogenetic relationships acr...

www.biorxiv.org

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plantgenomics.bsky.social @plantgenomics.bsky.social · Sep 2

Logan: Planetary-Scale Genome Assembly Surveys Life's Diversity
doi.org/10.1101/2024...

Logan: Planetary-Scale Genome Assembly Surveys Life's Diversity

The breadth of life's diversity is unfathomable, but public nucleic acid sequencing data offers a window into the dispersion and evolution of genetic diversity across Earth. However the rapid growth a...

doi.org

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Stephen Turner @stephenturner.us · Sep 2

Anyone can be the best: Impact of diverse methodologies on the evaluation of structural variant callers www.biorxiv.org/content/10.1... 🧬🖥️🧪 github.com/ldenti/svben...

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Joseph Schacherer @schacherer.bsky.social · Sep 1

Thrilled to share our latest work focusing on graph-based pangenome analysis highlighting structural and functional consequences of allopolyploidization

www.biorxiv.org/content/10.1...

Graph-based pangenome analysis uncovers structural and functional impacts of allopolyploidization events

The emergence of graph pangenomes has significantly advanced the study of structural variants (SVs) across diverse species. However, the impact of complex polyploidization events, particularly allopol...

www.biorxiv.org

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Vincent Zimmerman @zimmermanv66.bsky.social · Sep 1

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Rob Waterhouse @rmwaterhouse.bsky.social · Aug 27

Genetic diversity matters because it determines species' capacity to adapt, persist, & recover onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/... #biodiversity #genomics

Future Projections of Biodiversity Under Global Change Need to Include Genetic Diversity

This perspective argues that current methods for predicting biodiversity loss from future land use and climate change models are incomplete without incorporating projections of genetic diversity. Wit...

onlinelibrary.wiley.com

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Astropierre @astropierre.com · Aug 27

Très peu de personnes savent encore aujourd'hui qu'en avril 2025 a été inauguré l'Agence Spatiale Africaine destinée à "promouvoir la coopération et la coordination au sein de l'Union Africaine".

Très intéressant reportage de Galactic Chloé sur le sujet :

www.youtube.com/watch?v=pmpU...

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ERGA - European Reference Genome Atlas @ergabiodiv.bsky.social · Aug 26

⚡ Looking for an opportunity to share your work on #BiodiversityGenomics?
Submit an abstract for the Genomics for #Biodiversity Conference! (Oct 29–31 | fully online & free) 🧬

🔗 www.erga-biodiversity.eu/post/genomic...

@ebpgenome.bsky.social #genomics #conservation #bioeconomy #standarts

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Mathieu Gautier @mgda76.bsky.social · Aug 26

For those interested: 🚀 BayPass v3.1 released!
🔹 Improved MCMC adaptive phase
🔹 Computation reduced >6X with default (recommended) options, while keeping similar accuracy
🔹 Plus other minor edits

📖 Details in the manual / changelog
🔗 Repo: forge.inrae.fr/mathieu.gaut...

GAUTIER Mathieu / baypass public · GitLab

GitLab Community Edition

forge.inrae.fr

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The Conversation France @france.theconversation.com · Aug 17

Rosalind Franklin : la scientifique derrière la découverte de la structure de l’ADN, bien trop longtemps invisibilisée

Rosalind Franklin est l’oubliée du prix Nobel de médecine 1962. Découvrez son histoire et tous ses exploits scientifiques, notamment en virologie.

theconversation.com

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Nicolas Lambert @neocarto.bsky.social · Jul 30

Some experiments with Observable Notebooks 2.0 🥳
Actually it's really great. You can work offline. Notebooks can be hosted and deployed wherever you want. Here with Github pages. neocarto.github.io/observable-n...
cc @observablehq.com @ocks.org

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