「日本学術会議が能動的に意見を出せる仕組みがある」のに、政府の諮問がロクでもないから政府が悪い、と言って納得する国民は多くないと思いますよ。現実に酷い被害が出ている事象（HPVV、処理水、除染土、甲状腺検査など）に対し能動的に適切に振舞うことができないのに、きちんと諮問されたら良い提言ができる、とは、とても思えないです。
さらに、国際的な不正義（ロシアのウクライナに対する全面的な侵略戦争）に対しきちんと物申すことができないことを見せつけられたら、この組織を擁護しようと思う人は、少数派になっちゃうと思います。
「政治が科学を人事と金から押さえつけるとろくなことが起きない」に異論はありません。