Renske van Raaphorst 🟥
@vrrenske.bsky.social
microbiologist <3 microscopes
vanraaphorstlab.nl
vanraaphorstlab.nl
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
Bacteriologists - save the date for the next BacNet meeting in September 2026 #BacNet26 organised by @lalouxlab.bsky.social
Bacterial networks #BacNet26 in September 2026 will be chaired by @lalouxlab.bsky.social and co-chaired by @s-lab.bsky.social with @coralietesseur.bsky.social
Sneak peak on invited speakers and preliminary program:
meetings.embo.org/event/26-bac...
Sneak peak on invited speakers and preliminary program:
meetings.embo.org/event/26-bac...
November 20, 2025 at 8:58 AM
Bacteriologists - save the date for the next BacNet meeting in September 2026 #BacNet26 organised by @lalouxlab.bsky.social
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
Er komt een nieuw kabinet. Maar de onderwijsbezuinigingen van 606 miljoen op het hoger onderwijs staan nog. We blijven druk zetten op de politiek en komen we 9/12 weer in actie! Zorg dat je erbij bent✊
Stop de sloop van het hoger onderwijs‼️
📍De Dam, Amsterdam
📅Di 9/12
🕛12:00 uur
lnkd.in/eAh3bTwZ
Stop de sloop van het hoger onderwijs‼️
📍De Dam, Amsterdam
📅Di 9/12
🕛12:00 uur
lnkd.in/eAh3bTwZ
November 12, 2025 at 3:48 PM
Er komt een nieuw kabinet. Maar de onderwijsbezuinigingen van 606 miljoen op het hoger onderwijs staan nog. We blijven druk zetten op de politiek en komen we 9/12 weer in actie! Zorg dat je erbij bent✊
Stop de sloop van het hoger onderwijs‼️
📍De Dam, Amsterdam
📅Di 9/12
🕛12:00 uur
lnkd.in/eAh3bTwZ
Stop de sloop van het hoger onderwijs‼️
📍De Dam, Amsterdam
📅Di 9/12
🕛12:00 uur
lnkd.in/eAh3bTwZ
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
Terwijl het deze campagne nauwelijks gaat over onderwijs, stemde vandaag een rechtse meerderheid in de Eerste Kamer in met nieuwe bezuinigingen.
Weer met hulp van het CDA.
Hopelijk neemt iedereen met hart voor onderwijs of opgroeiende kinderen, dit mee in het stemhokje.
www.aob.nl/actueel/arti...
Weer met hulp van het CDA.
Hopelijk neemt iedereen met hart voor onderwijs of opgroeiende kinderen, dit mee in het stemhokje.
www.aob.nl/actueel/arti...
Vakbonden: 9 december demonstratie tegen ‘sloop’ hoger onderwijs
Er komt opnieuw een actie tegen de bezuinigingen op het hoger onderwijs op 9 december.
www.aob.nl
October 28, 2025 at 8:41 PM
Terwijl het deze campagne nauwelijks gaat over onderwijs, stemde vandaag een rechtse meerderheid in de Eerste Kamer in met nieuwe bezuinigingen.
Weer met hulp van het CDA.
Hopelijk neemt iedereen met hart voor onderwijs of opgroeiende kinderen, dit mee in het stemhokje.
www.aob.nl/actueel/arti...
Weer met hulp van het CDA.
Hopelijk neemt iedereen met hart voor onderwijs of opgroeiende kinderen, dit mee in het stemhokje.
www.aob.nl/actueel/arti...
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
#inktober day 6 with #Pierce
I am a day late, but the prompt for yesterday inspired me more than the one of today.
I could not resist drawing a specific nanoweapon called the type 6 secretion system.
In some bacteria like Vibrio cholerae, it is firing at random...
So the unexpected can happen.
I am a day late, but the prompt for yesterday inspired me more than the one of today.
I could not resist drawing a specific nanoweapon called the type 6 secretion system.
In some bacteria like Vibrio cholerae, it is firing at random...
So the unexpected can happen.
October 7, 2025 at 8:57 PM
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
🦠🔬🤖🧑💻 #mAIcrobe is out! With @pinholab.bsky.social's lab, we launched an open-source framework for high-throughput bacterial image analysis. By rockstars A. Brito & B. Saraiva et al, making #DeepLearning for phenotyping accessible! Easy to use, plus model training
📜 www.biorxiv.org/content/10.1...
📜 www.biorxiv.org/content/10.1...
October 22, 2025 at 11:10 AM
🦠🔬🤖🧑💻 #mAIcrobe is out! With @pinholab.bsky.social's lab, we launched an open-source framework for high-throughput bacterial image analysis. By rockstars A. Brito & B. Saraiva et al, making #DeepLearning for phenotyping accessible! Easy to use, plus model training
📜 www.biorxiv.org/content/10.1...
📜 www.biorxiv.org/content/10.1...
Paper from my former postdoc-lab @lalouxlab.bsky.social with extremely useful tools for the BALO people. Fantastic work by Charles et al. In my view, the paper is already worth scanning through for the joy of seeing these wild -ftsZ mutants 🦠
New tools unlock #Bdellovibrio bacteriovorus’s predatory secrets 🦠. By combining inducible gene expression with #CRISPRi-mediated depletion for precise control of essential genes, @lalouxlab.bsky.social uncovered new insights into its unique lifecycle and cell division.
buff.ly/FcDzAY4
buff.ly/FcDzAY4
October 14, 2025 at 12:03 PM
Paper from my former postdoc-lab @lalouxlab.bsky.social with extremely useful tools for the BALO people. Fantastic work by Charles et al. In my view, the paper is already worth scanning through for the joy of seeing these wild -ftsZ mutants 🦠
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
New tools unlock #Bdellovibrio bacteriovorus’s predatory secrets 🦠. By combining inducible gene expression with #CRISPRi-mediated depletion for precise control of essential genes, @lalouxlab.bsky.social uncovered new insights into its unique lifecycle and cell division.
buff.ly/FcDzAY4
buff.ly/FcDzAY4
October 14, 2025 at 9:02 AM
New tools unlock #Bdellovibrio bacteriovorus’s predatory secrets 🦠. By combining inducible gene expression with #CRISPRi-mediated depletion for precise control of essential genes, @lalouxlab.bsky.social uncovered new insights into its unique lifecycle and cell division.
buff.ly/FcDzAY4
buff.ly/FcDzAY4
Happy to finally show our story of the connection between nucleoid conformation, transcription & predation in our favorite predator Bdellovibrio bacteriovorus. 🧵 1/n
📝New preprint! #MicroSky
🕰️We chart the full, synchronized lifecycle of a predatory bacterium using Hi-C, RNA-seq, ChIP-seq & microscopy.
🧬We uncover dramatic shifts in nucleoid architecture & transcription, tightly coordinated with predation.
www.biorxiv.org/content/10.1...
🕰️We chart the full, synchronized lifecycle of a predatory bacterium using Hi-C, RNA-seq, ChIP-seq & microscopy.
🧬We uncover dramatic shifts in nucleoid architecture & transcription, tightly coordinated with predation.
www.biorxiv.org/content/10.1...
Dynamics and interplay of gene expression and chromosome organization across a predatory lifecycle
The obligate predatory bacterium Bdellovibrio bacteriovorus alternates between a motile attack phase and a growth phase inside another bacterium, during which it undergoes multiple rounds of DNA repli...
www.biorxiv.org
September 26, 2025 at 9:09 AM
Happy to finally show our story of the connection between nucleoid conformation, transcription & predation in our favorite predator Bdellovibrio bacteriovorus. 🧵 1/n
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
📝New preprint! #MicroSky
🕰️We chart the full, synchronized lifecycle of a predatory bacterium using Hi-C, RNA-seq, ChIP-seq & microscopy.
🧬We uncover dramatic shifts in nucleoid architecture & transcription, tightly coordinated with predation.
www.biorxiv.org/content/10.1...
🕰️We chart the full, synchronized lifecycle of a predatory bacterium using Hi-C, RNA-seq, ChIP-seq & microscopy.
🧬We uncover dramatic shifts in nucleoid architecture & transcription, tightly coordinated with predation.
www.biorxiv.org/content/10.1...
Dynamics and interplay of gene expression and chromosome organization across a predatory lifecycle
The obligate predatory bacterium Bdellovibrio bacteriovorus alternates between a motile attack phase and a growth phase inside another bacterium, during which it undergoes multiple rounds of DNA repli...
www.biorxiv.org
September 25, 2025 at 7:12 AM
📝New preprint! #MicroSky
🕰️We chart the full, synchronized lifecycle of a predatory bacterium using Hi-C, RNA-seq, ChIP-seq & microscopy.
🧬We uncover dramatic shifts in nucleoid architecture & transcription, tightly coordinated with predation.
www.biorxiv.org/content/10.1...
🕰️We chart the full, synchronized lifecycle of a predatory bacterium using Hi-C, RNA-seq, ChIP-seq & microscopy.
🧬We uncover dramatic shifts in nucleoid architecture & transcription, tightly coordinated with predation.
www.biorxiv.org/content/10.1...
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
Bezuinigingen op onderwijs zijn geen natuurwet, maar een politieke keuze. Een domme keuze vinden wij.
Daarom dienden we vandaag dit amendement in met een financiële dekking. Dus géén gratis bier.
Laten we hopen dat partijen die zeggen niet te willen bezuinigen, ook daad bij woord voegen!
Daarom dienden we vandaag dit amendement in met een financiële dekking. Dus géén gratis bier.
Laten we hopen dat partijen die zeggen niet te willen bezuinigen, ook daad bij woord voegen!
June 17, 2025 at 2:09 PM
Bezuinigingen op onderwijs zijn geen natuurwet, maar een politieke keuze. Een domme keuze vinden wij.
Daarom dienden we vandaag dit amendement in met een financiële dekking. Dus géén gratis bier.
Laten we hopen dat partijen die zeggen niet te willen bezuinigen, ook daad bij woord voegen!
Daarom dienden we vandaag dit amendement in met een financiële dekking. Dus géén gratis bier.
Laten we hopen dat partijen die zeggen niet te willen bezuinigen, ook daad bij woord voegen!
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
Some positive news in troubled times: New preprint by Vincent de Bakker, Xue Liu @jonbakerlab.bsky.social Infection-mimicking conditions+transcriptomics/proteomics/'essentialomics'/lipidomics shows many cool things!
www.biorxiv.org/content/10.1...
www.biorxiv.org/content/10.1...
Multi-omics profiling reveals atypical sugar utilization and identifies a key membrane composition regulator in Streptococcus pneumoniae
The human body comprises many different microenvironments, each with their own challenges for microorganisms to overcome in order to survive, and possibly cause infection. The human pathogen Streptoco...
www.biorxiv.org
June 15, 2025 at 9:23 PM
Some positive news in troubled times: New preprint by Vincent de Bakker, Xue Liu @jonbakerlab.bsky.social Infection-mimicking conditions+transcriptomics/proteomics/'essentialomics'/lipidomics shows many cool things!
www.biorxiv.org/content/10.1...
www.biorxiv.org/content/10.1...
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
New tenure track assistant professor position in molecular microbiology in our department @dmf-unil.bsky.social @unil.bsky.social! We are casting a wide net for an experimental molecular microbiologist. Apply here: wwwfbm.unil.ch/releve/appli...
DMF: Tenure Track Assistant Professor towards Associate Professor in Molecular Microbiology - Site des postulations FBM
wwwfbm.unil.ch
June 10, 2025 at 1:53 PM
New tenure track assistant professor position in molecular microbiology in our department @dmf-unil.bsky.social @unil.bsky.social! We are casting a wide net for an experimental molecular microbiologist. Apply here: wwwfbm.unil.ch/releve/appli...
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
Modulating gene expression and protein secretion in the bacterial predator Bdellovibrio bacteriovorus https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.05.17.654431v1
May 18, 2025 at 4:17 AM
Modulating gene expression and protein secretion in the bacterial predator Bdellovibrio bacteriovorus https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2025.05.17.654431v1
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
🧵5 Top Free Alternatives to BioRender for Scientific Illustrations!
These five websites offer free scientific illustrations for biologists. Great for presentations, research papers and other research communication needs.
Save and share the post!
These five websites offer free scientific illustrations for biologists. Great for presentations, research papers and other research communication needs.
Save and share the post!
May 13, 2025 at 7:55 PM
🧵5 Top Free Alternatives to BioRender for Scientific Illustrations!
These five websites offer free scientific illustrations for biologists. Great for presentations, research papers and other research communication needs.
Save and share the post!
These five websites offer free scientific illustrations for biologists. Great for presentations, research papers and other research communication needs.
Save and share the post!
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
Job alert 🦠🧪: We are looking for a postdoc (and PhD candidate!) to join our team at UCLouvain/de Duve institute in Brussels, Belgium. You will work on our ERC Starting Grant project aimed at characterizing cell cycle regulation in S. pneumoniae. More information here: dewachterlab.com/join-us/.
May 5, 2025 at 12:56 PM
Job alert 🦠🧪: We are looking for a postdoc (and PhD candidate!) to join our team at UCLouvain/de Duve institute in Brussels, Belgium. You will work on our ERC Starting Grant project aimed at characterizing cell cycle regulation in S. pneumoniae. More information here: dewachterlab.com/join-us/.
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
I forgot to post about this recent paper - exciting work led by @michriscopy.bsky.social showing clearest evidence yet for transertion strongly tethering the bacterial nucleoid to the membrane during fast growth. It was a pleasure to contribute a little 🔬🦠🧫 www.nature.com/articles/s41...
The nucleoid of rapidly growing Escherichia coli localizes close to the inner membrane and is organized by transcription, translation, and cell geometry - Nature Communications
The mechanisms underlying bacterial chromosome configuration are not fully understood. Here, Spahn et al. show that the Escherichia coli nucleoid adopts a condensed, membrane-proximal configuration du...
www.nature.com
May 9, 2025 at 2:37 PM
I forgot to post about this recent paper - exciting work led by @michriscopy.bsky.social showing clearest evidence yet for transertion strongly tethering the bacterial nucleoid to the membrane during fast growth. It was a pleasure to contribute a little 🔬🦠🧫 www.nature.com/articles/s41...
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
Excited to share our new preprint on HLp—a bacterial histone from Leptospira perolatii that forms stable tetramers and wraps ~60 bp of DNA: "DNA Wrapping by a Tetrameric Bacterial Histone" www.biorxiv.org/content/10.1...
@mpi-bio-fml.bsky.social
@mpi-bio-fml.bsky.social
May 12, 2025 at 9:17 AM
Excited to share our new preprint on HLp—a bacterial histone from Leptospira perolatii that forms stable tetramers and wraps ~60 bp of DNA: "DNA Wrapping by a Tetrameric Bacterial Histone" www.biorxiv.org/content/10.1...
@mpi-bio-fml.bsky.social
@mpi-bio-fml.bsky.social
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
Gisteren in #Wageningen.
2000 Wageningse studenten, docenten, psychologen, promovendi studieadviseurs, alumni, receptionisten en anderen op de been tegen bezuinigingen op het hoger onderwijs.
Dit beleid raakt ons allemaal. @woinactie.bsky.social #stopdesloop
2000 Wageningse studenten, docenten, psychologen, promovendi studieadviseurs, alumni, receptionisten en anderen op de been tegen bezuinigingen op het hoger onderwijs.
Dit beleid raakt ons allemaal. @woinactie.bsky.social #stopdesloop
April 15, 2025 at 6:09 AM
Gisteren in #Wageningen.
2000 Wageningse studenten, docenten, psychologen, promovendi studieadviseurs, alumni, receptionisten en anderen op de been tegen bezuinigingen op het hoger onderwijs.
Dit beleid raakt ons allemaal. @woinactie.bsky.social #stopdesloop
2000 Wageningse studenten, docenten, psychologen, promovendi studieadviseurs, alumni, receptionisten en anderen op de been tegen bezuinigingen op het hoger onderwijs.
Dit beleid raakt ons allemaal. @woinactie.bsky.social #stopdesloop
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
Zelfregulering? Misschien is het tijd voor een beetje zelfreflectie.
Is het werkelijk zo vreemd dat internationale studenten niet meer kiezen voor een land dat wordt geregeerd door een racistische regeringscoalitie?
Is het werkelijk zo vreemd dat internationale studenten niet meer kiezen voor een land dat wordt geregeerd door een racistische regeringscoalitie?
Het gaat de goede kant op met de daling van het aantal internationale studenten, stelt NSC-leider Pieter Omtzigt tevreden vast. Hij is van mening dat zelfregulering werkt, maar dat daarbij wel de Wet Internationalisering in Balans nodig is om druk te zetten op universiteiten en hogescholen.
Omtzigt: Zelfregie bij internationalisering werkt een stuk beter met de WIB - ScienceGuide
De minister is door universiteiten beloofd dat zij deze maand een zelfregieplan rondom internationalisering presenteren. Universiteiten willen daarmee de verplichte Toets Anderstalig Onderwijs voor he...
www.scienceguide.nl
April 14, 2025 at 8:05 AM
Zelfregulering? Misschien is het tijd voor een beetje zelfreflectie.
Is het werkelijk zo vreemd dat internationale studenten niet meer kiezen voor een land dat wordt geregeerd door een racistische regeringscoalitie?
Is het werkelijk zo vreemd dat internationale studenten niet meer kiezen voor een land dat wordt geregeerd door een racistische regeringscoalitie?
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
Fellow bacterial cell biologists, message me if you use @thermofishersci.bsky.social Gene Frames for microscopy!
Thermo are planning to discontinue these in September but have indicated they will look into this further.
If I make list of labs using them Thermo might not kill the product
Please RT🔬🦠
Thermo are planning to discontinue these in September but have indicated they will look into this further.
If I make list of labs using them Thermo might not kill the product
Please RT🔬🦠
Live Cell Imaging of Bacillus subtilis and Streptococcus pneumoniae using Automated Time-lapse Microscopy
42.1K Views. University of Groningen. This protocol provides a step-by-step procedure to monitor single cell behavior of different bacteria in time using automated fluorescence time-lapse microscopy....
www.jove.com
April 8, 2025 at 1:26 PM
Fellow bacterial cell biologists, message me if you use @thermofishersci.bsky.social Gene Frames for microscopy!
Thermo are planning to discontinue these in September but have indicated they will look into this further.
If I make list of labs using them Thermo might not kill the product
Please RT🔬🦠
Thermo are planning to discontinue these in September but have indicated they will look into this further.
If I make list of labs using them Thermo might not kill the product
Please RT🔬🦠
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
😢😢😢. Ze deden het dus tóch.
Woinactie hoopt dat universiteiten nu inderdaad, zoals aangekondigd, deze bezuinigingen aanvechten bij de rechter.
#KabinetSlooptHogerOnderwijs
Woinactie hoopt dat universiteiten nu inderdaad, zoals aangekondigd, deze bezuinigingen aanvechten bij de rechter.
#KabinetSlooptHogerOnderwijs
De Eerste Kamer heeft zojuist ingestemd met de bezuinigingen op het hoger onderwijs.
April 8, 2025 at 12:00 PM
😢😢😢. Ze deden het dus tóch.
Woinactie hoopt dat universiteiten nu inderdaad, zoals aangekondigd, deze bezuinigingen aanvechten bij de rechter.
#KabinetSlooptHogerOnderwijs
Woinactie hoopt dat universiteiten nu inderdaad, zoals aangekondigd, deze bezuinigingen aanvechten bij de rechter.
#KabinetSlooptHogerOnderwijs
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
Vandaag in de estafette staking: Rotterdam!
Zet hem op, Erasmus en co!
#DoeHetNiet
#KabinetSlooptHogerOnderwijs
www.erasmusmagazine.nl/2025/04/08/l...
Zet hem op, Erasmus en co!
#DoeHetNiet
#KabinetSlooptHogerOnderwijs
www.erasmusmagazine.nl/2025/04/08/l...
Liveblog: Medewerkers staken vandaag tegen onderwijsbezuinigingen - Erasmus Magazine
Medewerkers en studenten van de Erasmus Universiteit staken vandaag tegen de bezuinigingen op hoger onderwijs en wetenschap. EM houdt de hele dag een liveblog bij.
www.erasmusmagazine.nl
April 8, 2025 at 6:12 AM
Vandaag in de estafette staking: Rotterdam!
Zet hem op, Erasmus en co!
#DoeHetNiet
#KabinetSlooptHogerOnderwijs
www.erasmusmagazine.nl/2025/04/08/l...
Zet hem op, Erasmus en co!
#DoeHetNiet
#KabinetSlooptHogerOnderwijs
www.erasmusmagazine.nl/2025/04/08/l...
On my way to #KNVM2025 - this afternoon we host a session on non-canonically growing microbes, with @s-lab.bsky.social speaking. Looking forward! 🦠
April 2, 2025 at 5:51 AM
On my way to #KNVM2025 - this afternoon we host a session on non-canonically growing microbes, with @s-lab.bsky.social speaking. Looking forward! 🦠
Reposted by Renske van Raaphorst 🟥
Join our favorite microbiology meeting! Fantastic talks, poster sessions, new technologies, and all the hot areas of microbiology in a great environment - experts in cell & systems biology, microbiomes, environment & evolution, pathogenesis, phage & antibiotics
DON’T MISS abstract deadline, April 1
DON’T MISS abstract deadline, April 1
March 26, 2025 at 9:23 AM
Join our favorite microbiology meeting! Fantastic talks, poster sessions, new technologies, and all the hot areas of microbiology in a great environment - experts in cell & systems biology, microbiomes, environment & evolution, pathogenesis, phage & antibiotics
DON’T MISS abstract deadline, April 1
DON’T MISS abstract deadline, April 1
Ha, from the image I thought "that looks like something from Liselot's paper" - and it was. I've apparently looked at exploding pneumo's often enough in my life to recognize the specific ones 😅 @liselotdewachter.bsky.social
March 24, 2025 at 10:49 AM
Ha, from the image I thought "that looks like something from Liselot's paper" - and it was. I've apparently looked at exploding pneumo's often enough in my life to recognize the specific ones 😅 @liselotdewachter.bsky.social